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学习小组Day5笔记--damon

学习小组Day5笔记--damon

作者: Damon伍 | 来源:发表于2018-09-15 00:03 被阅读1次

第5天回趟家,surface突然抽风,弄了好久终于无限重启好了。
以下内容均引用自微信公众号生信星球

思维导图

写在前面

  • 1.在Console 控制台输入命令,相当于Linux的命令行
  • 2.向量是由元素组成的,元素可以是数字或者字符串。
  • 3.表格在R语言中叫数据框
  • 4.数据类型:

向量,矩阵,数组,数据框,list

向量

  • 1.“元素”的意思,元素指的是数字或者字符串(用chr表示)

标量:一个元素组成的变量
向量:多个元素组成的变量

x<-c(1,2,3) #把1,2,3组成的向量定义为X。
x<-(1:10) #从1-10之间所有的整数
x<-seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意这里是逗号不是分号)
x<-rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
  • 2.从向量中提取元素
  • a.根据位置
#这里的x是你刚才赋值的变量名,根据自己的情况来修改
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了……
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
  • b.根据值的大小
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素

数据框(重要)

  • 1.读取实例数据框:
    X<-read.csv('doudou.txt')
  • 也可用read.table
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T) #读取文件,分隔符为Tab,有表头 

a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把这个数据框赋给一个变量a 
  • 2.设置列名和行名
X<-read.csv('doudou.txt') 
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"damon"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

(用read.table命令可以撤销修改,重载)

  • 3.数据框导出
write.table(X,file = "damon.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号) 
damon.txt
  • 4.保存数据
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一个变量
load("frame1.RData")#再次使用RData时的加载命令
  • 5.提取元素
- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列(横着写第y列)
- X[y] #第y列(竖着写第y列)
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列(只能提取一列)
  • 6.直接使用数据框中的变量
    提取某两列作散点图,A,B列:
c <-data.frame(A=paste("S",c(1:50)),B=runif(50))
> plot(c$A,c$B)
  • 简洁方法,
  • 1.attach

将数据框名添加到搜索环境中:attach(c),作图时就只需输入列名(连$都不用了)。

attach(c)
plot(A,B)
  • 2.with
with(c,{
+ plot(A,B)
x<<-summary(B)   #赋值给x,<<的意思是作为全局变量,也就是出了with循环仍有效。
})
x #运行完后输出x

(跑出来了还不太理解,先把作业交了,破电脑)

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