安装
提示 STAR 找不到，在perl 中直接修改路径
注意：star-fusion 的版本和star 版本要匹配，最初的时候由于start 版本过高，无法运行
下载数据库
genome resouce lib：
https://data.broadinstitute.org/Trinity/CTAT_RESOURCE_LIB/
图片.png
运行命令：
./STAR-Fusion --left_fq ./testing/reads_1.fq --right_fq ./testing/reads_2.fq --genome_lib_dir /Data/userhome/database/STAR-Fusion/GRCh38_gencode_v33_CTAT_lib_Apr062020.plug-n-play/ctat_genome_lib_build_dir
运行结果：
STAR-Fusion_outdir 目录内
安装提示 STAR 找不到，在perl 中直接修改路径 注意：star-fusion 的版本和star 版本要匹配...
STAR-Fusion --genome_lib_dir /media/pc/6a524d78-97d1-481c...
就是STAR-fusion啦，它可以直接基于STAR比对好的bam文件来做分析，而大多数其它融合基因查找工具，需要...
欢迎关注”生信修炼手册”! STAR是目前主流的RNA-seq比对软件之一，而STAR-fusion就是一款基于S...
我们多次在生信技能树公众号介绍过star-fusion这个目前最好的针对RNA-seq测序数据找融合基因的软件：最...
前些天我在生信技能树介绍过star-fusion：最好用的融合基因查找工具终于正式发表了 ，然后在另外一个教程：一...
下载大文件一定要md5校验一下 因为要使用STAR-fusion软件，里面提到了配置好的数据库文件，我就想直接下载...
1、融合基因介绍 融合基因（fusion gene），是指两个基因的部分序列发生融合形成的嵌合基因，一般由于染色体...
本文标题：STAR-fusion
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/yhxtoktx.html
网友评论