STAR-fusion

安装
提示 STAR 找不到，在perl 中直接修改路径

注意：star-fusion 的版本和star 版本要匹配，最初的时候由于start 版本过高，无法运行

下载数据库
genome resouce lib：
https://data.broadinstitute.org/Trinity/CTAT_RESOURCE_LIB/

图片.png

运行命令：
./STAR-Fusion --left_fq ./testing/reads_1.fq --right_fq ./testing/reads_2.fq --genome_lib_dir /Data/userhome/database/STAR-Fusion/GRCh38_gencode_v33_CTAT_lib_Apr062020.plug-n-play/ctat_genome_lib_build_dir

运行结果：
STAR-Fusion_outdir 目录内