一、调控通路:
LncRNA MD1上有一段miR-133的前体序列。在细胞分化前,HuR蛋白结合到Lnc-MD1上抑制Lnc-MD1的剪切断裂,Lnc-MD1作为miR-133的海绵吸附体使miR-133前体序列结合miR-133,解除miR-133对HuR Mrna翻译的抑制促进HuR的表达。在细胞分化时,Lnc-MD1断裂释放miR-133前体使miR-133表达升高,miR-133结合到HuR mRNA的3’-UTR上抑制HuR的表达从而使得Lnc-MD1又可作为miR-133的前体。
二、实验流程:
作者首先进行荧光素酶实验检测HuR与Lnc-MD1的关系以及对Lnc-MD1过表达和敲低后检测HuR的表达,表明LncMD1对HuR的促进作用。随后分别用RIP和RNA pull-down来验证Lnc-MD1与HuR、Ago2的结合,用RNA-RNApull-down验证Lnc-MD1与miR-133结合。然后通过EMSA实验验证HuR与Lnc-MD1并验证了与Lnc-MD1的结合位点说HuR结合到Lnc-MD1上的miR-133前体序列上。最后作者通过检测细胞分化过程中的Lnc-MD1、miR-133和HuR的表达,以及检测HuR敲低后的Lnc-MD1的表达,表明HuR抑制Lnc-MD1转变为miR-133。
三、核心FIGURE:
Figure 1.说明的是Lnc-MD1对HuR蛋白表达的影响A-C、荧光素酶实验,将HuR mRNA3’-UTR连接到荧光素酶报告质上 与Lnc-MD1表达质粒共转染后检测细胞的荧光素酶活性。
E、Q-PCR检测Lnc-MD1过表达/敲低,WB检测Lnc-MD1过表达/敲低后HuR蛋白的表达。表明Lnc-MD1促进HuR的表达。
Figure2说明的是HuR与Lnc-MD1结合后,Lnc-MD1作为miR-133的吸附体结合miR-133。A、RIP实验,用HuR蛋白抗体从小鼠和人的细胞中钓取与HuR结合的RNA,然后进行Q-PCR检测,表明HuR与Lnc-MD1结合。
B、Ago2-RIP,用Ago2抗体钓取与Ago2蛋白结合的RNA,然后然后进行Q-PCR检测,表明Ago2与Lnc-MD1结合。
C、RNA pull-down/RNA-RNA pull-down,用Lnc-MD1探针钓取与之结合蛋白和RNA,产物进行WB和Q-PCR检测,表明Lnc-MD1能与HuR、Ago2蛋白结合,也与miR-133高度结合。
D、EMSA实验,用Lnc-MD1探针与HuR进行体外结合实验,表明lnc-MD1包含miR-133序列区段与HuR结合。
E、EMSA实验,用MD1-133b探针与冷探针进行体外结合HuR实验,表明两者具有竞争关系。
F、EMSA实验,用MD1-133b探针、突变探针和HuR进行体外结合实验,突变后的MD1-133不与HuR结合。
Figure3说明的是HuR对Lnc-MD1和miR-133的影响A、细胞分化过程中WB检测HuR,RT-PCR检测Lnc-MD1,NB检测miR-133的表达。表明在细胞分化中期(48-72h)HuR和Lnc-MD1表达升高,在分化后期HuR和Lnc-MD1表达下降,而pre-miR-133b和miR-133b的表达升高。
B、Lnc-MD1作为miR-133前体的示意图。
C、Q-pcr检测HuR敲低后Lnc-MD1、pre-miR-133b和miR-133b的表达,表明HuR敲低后,Lnc-MD1下降,pre-miR-133b和miR-133b升高。
参考文献:Ivano Legnini,MariangelaMorlando,Arianna Mangiavacchi,et al.A Feedforward Regulatory Loop between HuR andthe Long Noncoding RNA linc-MD1 Controls Early Phases of Myogenesis.Molecular Cell,2013,53, 506–514
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