ref1:链特异建库那点事 - 简书
ref2:RNA-Seq 分析链特异性参数设置汇总 - 知乎
有空需要仔细琢磨下!


比对参数:
hisat2 : --rna-strandness RF
cufflinks : --library-type fr-firststrand
Trinity: --SS_lib_type RF
tophat:--library-type fr-firststrand
STAR: --outSAMstrandField intronMotif
表达定量参数:
featureCounts -s 1
htseq-count -s yes
stringtie --rf
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