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miRCancer:肿瘤相关的miRNA表达谱数据库

miRCancer:肿瘤相关的miRNA表达谱数据库

作者: 生信修炼手册 | 来源:发表于2019-01-02 17:27 被阅读72次

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    miRNA具有重要的转录后调控功能,在疾病的发生与发展中扮演着重要角色。miRCacner是一个肿瘤相关的miRNA数据库,通过收集和整理文献,给出肿瘤相关的miRNA以及对应的表达趋势,网址如下

    http://mircancer.ecu.edu/index.jsp

    通过Browse功能,可以查看该数据库中的记录,示意如下

    对于每种肿瘤,列出了相关的miRNA以及在患病者中的表达趋势,还给出了对应的文献,点击miRNA的链接,可以在mirBase数据库中查看miRNA的详细信息,点击对应的文献可以跳转到pubmed。

    官网也提供了检索功能,示意如下

    可以根据miRNA的名字或者肿瘤的名字进行检索。该数据库是免费下载的,每个版本数据量示意如下

    当分析某种肿瘤的miRNA数据时,通过该数据库,可以快速检索得到已有的肿瘤相关miRNA的研究结果,因为给出了miRNA的表达趋势,可以和自己的miRNA数据相互印证。

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