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计算MiRNA–mRNA表达相关性

计算MiRNA–mRNA表达相关性

作者: 因地制宜的生信达人 | 来源:发表于2018-12-25 18:45 被阅读47次

    计算MiRNA–mRNA表达相关性

    看到一篇文章提到了这个分析,作者下载了TCGA数据库的OV的Affymetrix HT HG-U133A arrays, n = 598表达矩阵和Agilent 8 × 15 K Human miRNA-specific microarray的表达矩阵。

    使用 Maximal Information Coefficient (MIC) 这个算法来计算计算MiRNA–mRNA表达相关性,这个算法来自于文献:D. N. et al. Detecting novel associations in large data sets. Science 334, 1518–1524 (2011).

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