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EDTA 安装备忘

EDTA 安装备忘

作者: 吴十三和小可爱的札记 | 来源:发表于2020-10-10 18:12 被阅读0次

    简介

    EDTA 是一个集合了LTR预测工具,TIR预测工具,MITE预测工具和Helitrons预测工具的自动全基因组TE注释和TE注释结果检测的综合性的流程。

    安装

    conda安装

    conda create -n EDTA
    conda activate EDTA
    conda install -c bioconda -c conda-forge edta
    
    

    报错

    1. Error: gt is not found in the genometools path !


    找到问题,但搜索genometools时它在EDTA环境中,推测可能是没有执行权限?

    chmod u+x .../miniconda3/.../genometools
    

    解决~~!

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