R可视化——气球图

作者: 科研那点事儿 | 来源:发表于2022-07-18 06:31 被阅读0次

        ggballoonplot(气球图)是一种用于多分类数据展示的图形,图中每个单元格都包含一个点,其大小反映了相应样本的相对大小。如果我们平时看惯了柱状堆积图,不妨试试这个图形,也许会让你眼前一亮!今天,小编主要通过ggpubr包及ggplot2包展示两种绘制方法!

    1、加载包

    rm(list=ls())#clear Global Environment
    setwd('D:\\桌面\\气球图')#设置工作路径
    
    #加载包
    library(ggpubr)
    library(reshape2)
    library(ggplot2)
    

    2、加载数据

    df <- read.table(file="Genus.txt",sep="\t",header=T,check.names=FALSE,row.names = 1)
    head(df)
    
    image.png

    3、基于ggpubr包绘制

    1)简单绘制
    ggballoonplot(df)
    
    image.png
    2)个性化设置
    color=c("blue", "white", "red")
    ggballoonplot(df, 
                  fill = "value", #气球填充颜色
                  ggtheme = theme_bw(),#画板主题
                  size = "value",#气球大小
                  color = "grey",#气球边框颜色
                  shape = 22,#shape可以改变显示形状
                  show.label = F)+#是否显示标签
      scale_fill_viridis_c(option = "C")+
      guides(size = FALSE)+#气球图例是否显示
      scale_fill_gradientn(colors = color)#设置颜色
    
    image.png
    3)其他参数
    ggballoonplot(
      data,#数据集
      x = NULL,#x轴向量
      y = NULL,#y轴向量
      size = "value",#气球大小依据
      facet.by = NULL,#气球形状选择
      size.range = c(1, 10),#气球大小选择范围
      shape = 21,#气球形状
      color = "black",#气球边框颜色
      fill = "gray",#气球填充颜色
      show.label = FALSE,#是否显示每个气球代表的具体大小
      font.label = list(size = 12, color = "black"),#示每个气球代表的具体大小的字体设定
      rotate.x.text = TRUE,#是否旋转标注字体
      ggtheme = theme_minimal(),#画板主题
      ...)
    

    4、基于ggplot2包绘制

    1)数据处理
    #转换数据
    df$Tax=rownames(df)
    df1=melt(df)
    colnames(df1)=c("Tax","Samples","value")
    
    2)绘图
    plot(df1, aes(x = Samples, y = Tax, size = value, color=Samples)) + 
      geom_point(aes(size=value))+
      theme(panel.background = element_blank(),
            panel.grid.major = element_line(color = "gray"),#网格线条颜色
            panel.border = element_rect(color="black",fill=NA))#边框色
    
    image.png
    **源码及数据在公众号后台回复\color{red}{“气球图”}获取!!!

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