鉴定细胞类型常用的方法

作者: 生信编程日常 | 来源:发表于2020-12-07 20:34 被阅读0次

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细胞鉴定方法

常用的R包：SingleR、celaref、metacell、scMCA/scHCL等

网站：CellMarker
http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/CellMarker/
CellMarker通过收集超过100 000篇已发表的文献，总结了上万个细胞标记基因，涉及人类467种细胞类型，以及鼠的389种细胞类型。

可以查询小鼠脑细胞类型的差异基因以及位置的网站
1).Exploring the Mouse Brain through Single Cell Expression Profiles
http://dropviz.org

2).http://mousebrain.org

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