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回归结果可视化

回归结果可视化

作者: R语言与SPSS学习笔记 | 来源:发表于2021-03-28 21:12 被阅读0次
    8.png

    亲爱的朋友们,大家还在用以下的这种表格来展示你的回归结果吗?(包括Logistic回归,多元线性,Cox回归等)(文章链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0160412018331830?via%3Dihub

    1.png

    这种表格看起来虽然很整齐,但是不够直观。如果我们想让回归结果更直观该怎么办?让我们来看看柳叶刀杂志上是怎么做的:

    2.png

    上图是一个多元线性回归的结果,作者是用一个森林图进行展示。这是一篇2021年发表在柳叶刀的论文,IF=60.392,文章链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7846817/

    3.png

    如果你再找找,你就会发现柳叶刀杂志上发现很多这种森林图,文章链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7833295/

    4.png
    5.png

    那么,这种展示回归结果的森林图怎么做的呢?今天我们以Logistic回归结果为例,跟大家一起学习。

    现在我们需要把Logistic回归结果整理成下面的格式:

    6.png

    1. 数据保存为csv格式,读取数据:

    mydata=read.csv(file="D:\\data.csv",header=T)
    

    2. 加载包:

    library(grid)
    library(magrittr)
    library(checkmate)
    library(forestplot)
    

    3. 简单画图:

    forestplot(labeltext=as.matrix(mydata [,1:3]),mean= mydata$x4,
    
    lower= mydata$x5,upper= mydata$x6,zero=1,
    
     boxsize=0.2,graph.pos=2)
    

    生成的森林图如下图:

    7.png

    4. 图形美化:

    forestplot(labeltext=as.matrix(mydata[,1:3]),#只展示前面的三列
    
     mean= mydata$x4,#OR值
    
     lower= mydata$x5,#95%CI下限
    
     upper= mydata$x6,#95%CI上限
    
     zero=1,#OR值的位置,如果是线性回归则选择0
    
     boxsize=0.2,#中间方框的大小
    
     xticks=c(0.5,1,1.5),#x轴刻度
    
     lwd.zero=2,#中间竖线的宽度
    
     lwd.ci=2,
    
     col=fpColors(box='orange',lines = 'orange',zero = 'gray'),#颜色,box,lines和zero分别是方框,线条,中间竖线的颜色
    
     xlab="OR",#x轴标签
    
     lwd.xaxis =1,
    
     txt_gp = fpTxtGp(ticks = gpar(cex = 0.85),xlab = gpar(cex = 0.8),
    
     cex = 0.9),#设置字体大小
    
     lty.ci = "solid",
    
     title = "Forestplot", #标题
    
     graph.pos=2#中间竖线的位置
    
     )
    
    

    经过调整生成的森林图形如下:

    8.png

    柳叶刀的结果展示方式你都学会了,是不是离高分杂志又近了一步呀!

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