现在很多数据都要上传到国内的GSA网站，申请账户就不讲了，主要讲如何上传。其中使用Aspera上传的速度最快也最方便，而使用过程也很简单
首先用conda安装一下Aspera
conda install -c hcc aspera-cli
然后下载一下这个key file,得到文件名叫aspsub_rsa，将其放在-i后面,这个相当于你在这个网站的验证码
image.png
ascp -P33001 -i aspsub_rsa -l100m -k1 -d 文件夹名 aspsub@账户
然后就等待上传成功就行了，这里限制了上传上限为100M，其实你也可以改为200m乃至更高
然后等待GSA的数据的md5核验，核验成功就好了
最近需要下载一批重测序数据，其上传到了GSA数据库，因此需要到GSA数据库进行查询和下载。GSA(Genome S...
为发表论文故，测序数据一般需要上传至公共数据库，对我们而言，国外数据库一般选NCBI，国内的可上传至GSA。 自从...
在SRA上传数据，较大的文件，直接http上传容易断点，一般会使用Aspera connect进行上传。以wind...
之前提到Aspera 上传基因组数据到NCBI[https://www.jianshu.com/p/cd4a673...
最近，需要上传数据到NCBI，因为数据量有2T左右，所以考虑用aspera。但是报错如下： （1）其实NCBI已经...
完成基因组后，需上传数据，比如到NCBI，这一步可以选择Aspera进行操作 上传基因组或者原始数据一般流程如下 ...
上传测序数据到SRA数据库。参考链接1aspera的使用1.注册NCBI账户2.https://submit.nc...
1.先注册NCBI账户,然后访问https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/...
#1 安装Aspera 下载地址：https://downloads.asperasoft.com/connect...
惭愧，文章拖了这么久又有重新审稿了，之前的编辑挺看好的，结果2020年年底闭刊了，编辑觉得还有问题需要修改，来不及...
本文标题：Aspera上传数据到国内GSA网站
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/zkcegdtx.html
网友评论