这几天有老师问关于全转录组测序你们可以做吗？

我们的回答是：我们虽然是主做单细胞测序，但其他测序我们都是有完整的体系哦，关于测序统统看过来，随时欢迎各位老师咨询。

什么是全转录组测序?

转录组狭义上指某一生理条件下细胞内所有mRNA的集合，广义上是指某一生理条件下细胞内所有转录产物的集合，包括mRNA和非编码RNA（non-coding RNA，ncRNA）。非编码RNA包括具有调控功能的ncRNA和管家基因（如tRNA、rRNA等）。

对转录组中的非编码RNA，目前的研究多集中在具有调控功能的small RNA（以microRNA为代表）、长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）和环状RNA（circular RNA，circRNA）上，而这几类ncRNA的调控对象都和mRNA有关。

因此，全转录组即包含了ncRNAs和mRNA，其并不是一个新概念，提出全转录组的概念是为了与狭义的转录组概念（mRNA）有所区分。

几种RNA的简介

LncRNA

长链非编码RNA是指长度超过200nt，不具有蛋白编码功能的一类RNA分子。存在带poly(A)尾和不带poly(A)尾两种形式。其表达受发育调控，具有组织和细胞特异性，但是物种之间保守性差。lncRNA主要存在于细胞核中，其数量是的mRNA的3-100倍。目前研究提示lncRNA的功能机制主要包括参与转录调控、转录后调控、蛋白质运输和mRNA降解等过程。

Circular RNA

Circular RNA为一种特殊的非编码RNA分子，呈闭合环状结构。广泛存在于生物体内，与线性RNA相比，稳定性高，circRNA对microRNA具有重要调控作用。

microRNA

microRNA是一种大小约21-23个碱基的单链小RNA，microRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体（RISC）降解mRNA或抑制mRNA的翻译，从而在转录后水平调控蛋白表达。

mRNA

mRNA占细胞总RNA的3%左右，但由于其最终翻译成蛋白质，参与人类生长、发育、疾病发生发展等一系列的生物学过程，一直是研究的焦点。

文库构建流程

当然文库构建完成后，进行高通量测序，获得的数据可进行整合分析，分析包括标准分析和联合分析。

王俊杰 | 文案

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