2019-07-20学习总结

step_1 创建向量

函数c() 、 sep() 、 rep() 、 paste() 、 paste0()

step_2 索引

可以用位置、名字、逻辑值进行索引

###位置
ve_1[2:3]
###名字 
ve_1['mon']
###逻辑值 
num<6
num[num<6] 
##或给逻辑值赋值
a <- num<6 
num[a]

step_3 矩阵

矩阵创建方法

1.先创建一个向量a<-seq(1,20,1)
加上维度dim(a)<-c(5,4)
2.直接用矩阵函数d<-matrix(b,nrow=5,ncol=4)

索引

####行和列
e[,2]
####名字
e[,'mon']
####逻辑值
tmp<-c(T,F,T,T,F,F)
e[c(T,F,T,T,F,F),]

获取e的奇数行内容

nrow(e)
a <- 1:nrow(e)
tmp <- a%%2==1
e[tmp,]

step_4数据框

创建矩阵

April<-data.frame(date,plan,color)

索引

####位置（行和列）
April[1,2]
####名字
April[2,c('plan','date')]
####逻辑值
tmp<-c(T,F,T)
April[tmp,]
April[c(T,F,T,T,F),]
####新的索引符号$
April$date

列表

创建列表

g<-'Hello world'
h<-1:5
j<-matrix(1:10,nrow=5,ncol=2)
f<-c('mon','tue','wed')
r_list<-list(flag=g,h,j,f)

索引

列表没法定义明确的行和列，不能用行和列进行索引。列表中的每一个数据结构即为一个元素，所以可以将其看做一个特别的向量，用位置进行索引
特殊的符号：[[]]

r_list[[1]]

也可用$符号

r_list$flag

可对其进行再次索引

r_list[[2]][1]

step_5 读写文件

a<-read.csv('GSE17215_series_matrix.txt.gz')###如果读入CSV文件，就用read.csv（）函数；读入TXT文件，则用read.table（）函数。
write.table(x = f,file = '0418.txt')###前面是指定编码格式，后面是用什么格式打开。所以前后一致最好。

step_6循环

for循环

格式:for(i in 1:10){ }###前面指的是循环数即i的值从几到几，后面指的是具体执行操作

apply循环

格式：apply(x,margin,function)###x为操作对象；margin=‘1’，行，margin=‘2’，列；function为特定函数（可自定义函数）
如：在apply循环中自定义一个函数

apply(test, 1, y)###变量即为test的行，所以x即为test的行
y <- function(x){
  sd <- sd(as.numeric(x[1:3]))
  mean <- mean(as.numeric(x[1:3]))
  paste0 <- paste0(x[4],'day')
  result<-c(sd,mean,paste0)
  return(result)
}
a <- apply(test, 1, y)