https://blog.csdn.net/Gossie/article/details/109320960
https://blog.csdn.net/Gossie/article/details/109320960[ht...
使用BWA+samtools+gatk4.0进行SNP calling 首先下载数据eg: 01.align 首先...
GATK(全称The Genome Analysis Toolkit)是Broad Institute开发的用于二...
最近在FAFU学习,需要snp calling。本来想用bwa-GATK的流程来做,老板说不用这么麻烦,用sent...
使用GATK进行SNP和INDEL检测GATK是 Broad 开发的用于测序数据的变异检测软件,后续推广到动植物研...
通过GATK calling出来的SNP如果使用UnifiedGenotype获得的SNP文件是分sample的,...
以GATK流程为例,简单来说,SNP Calling主要包括以下几步: 1. 给参考基因组建立索引:samtool...
trimmomatic:常用于处理原始测序数据 GATK:功能强大,尤其是variant calling 下载 安...
gVCF文件生成:GATK4 —— Variant Calling (SNP+indel) - 简书 (jians...
call SNP GATK bwa+samtools 参考文档 一、原始数据处理 测序得到的RAW D...
本文标题:用GATK进行二代测序数据 SNP Calling 流程:(四)
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/zrrwaltx.html
网友评论