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什么?热图,你不会掰弯?

什么?热图,你不会掰弯?

作者: 生信石头 | 来源:发表于2019-07-19 23:34 被阅读306次

写在前面

很久很久以前,TBtools推出了热图工具。在后续用户的使用过程中,我们发现,有时候我们可能像一次展示上百个基因。这样会使得整个图片显得很长,以至于一张A4纸可能都完全放不下,如下


对于这种情况,在之前的推文,我也已经提过,直的不行,那么就掰弯嘛。TBtools使用的是我早前开发的绘图引擎JIGplot,所以几乎所有图形都是可以掰弯的,热图也不例外,如下:

掰弯的热图提出来之后,有几个朋友使用了也最终发表于学术期刊,但在此同时,有较多用户总是遇到不知道如何掰弯这个问题。
这几天,我们课题组在做暑期培训,同样的,参与讨论的不少朋友也是掰不弯,可能大家都太直了吧。

TBtools热图增加自动掰弯功能!

是的,我一直并没有去增加这个自动掰弯的功能。其中一个主要的原因是,我觉得似乎并没有必要,毕竟似乎这种热图不一定很多人会喜欢。但事实似乎不是如此。这个掰弯热图给我带来更多的用户问题,这并不是我想看到的。既然,你们掰不弯,那么我就提供一个快捷方式,让大家随时可以掰弯
首先,绘制出普通的热图,参考以前公众号的推文即可


点击可得

点击Show Control Dialog,即打开控制参数,点击Auto Polar,随后,按照自己的需求调整对应的参数即可。

我们当然是可以聚类,不过,暂时只支持对行的聚类

当然,我们会进行行标准化,进行颜色变换调整Legends的摆放方式

轻轻松松,你可以得到很久以前,对外摆出的孔雀热图

写在最后

OK,暑期培训,我负责的区块已经讲演完毕。要开始赶课题啦。
最后,祝大家科研顺利。

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