TCGA数据分析 (1) : 如何从TCGA下载数据TCGA数据分析 (2)：如何从TCGA检索数据TCGA数据分...[作者空间]
由于下载的TCGA数据，都是独立文件夹。即每个样本，一个文件夹，文件夹下是压缩数据，还需要将所有的数据进行解压，然...[作者空间]
对TCGA数据分析之前已经介绍过一次，这里把之前的内容整理下。TCGA分析大致可分为以下：1.数据检索与下载2.m...[作者空间]
上一次讲述了如何利用snakemake进行RNA-seq分析流程的构建：RNAseq分析流程：从测序Rawdata...[作者空间]
1.提取miRNAs 2. 由starbase API数据库进行下载(10s检索完成） 3.将所有的miRNA靶基...[作者空间]
1.提取这298个lncRNAs的symbol 2. 由starbase API数据库进行下载 不到一分钟将全部l...[作者空间]
找数据 首先在NCBI FTP网站上找到自己需要的数据https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/s...[作者空间]
系统信息 arch 显示机器的处理器架构(1) uname -m 显示机器的处理器架构(2) uname -r 显...[作者空间]
参考文章：https://www.cnblogs.com/liaohuiqiang/p/9380417.html ...[作者空间]
原文英文链接：ChIP-Seq Workflow Template作者：Daniela Cassol (danie...[作者空间]
RNA-seq分析流程 不得不提的一篇文献Sahraeian, Sayed Mohammad Ebrahim, e...[作者空间]
0定义变量 1 标记PCR重复reads 运行结束后的文件如下 2 FixMateInformation 这样就得...[作者空间]
1 先查看sam文件 随机选择3个 再看另外一个： 关于samtools mpileup的具体用法和结果解释请看 ...[作者空间]
参考文章：https://www.cnblogs.com/xiaofeiIDO/p/6805373.html1、v...[作者空间]
https://www.runoob.com/docker/centos-docker-install.htmlh...[作者空间]
1、加权共表达网络分析（WGCNA）步骤： （1）构建共表达网络：根据基因与基因之间的相关性建立（2）划分模块：表...[作者空间]
LNCipedia数据库https://lncipedia.org/ 只是人的lncRNA综合数据库 starBa...[作者空间]
一、数据预处理（Data Pre-processing）介绍 这一步主要是对BWA得到的bam进行一系列处理（包括...[作者空间]
