基于测序数据得到的候选变异,如何判定突变是否有害呢?准确区分中性突变与致病突变对遗传病的临床检测有着重要的意义,研...[作者空间]
1. 在Rstiduo中安装自己的orgDb包 2. 载入R包并大致查看一下R包的内容 可用keys()命令查看一...[作者空间]
1.首先安装eggnog-mapper软件 注释所需要的物种数据库网址如下,同时也可以用里面的脚本download...[作者空间]
FGNet介绍 FGNet(Functional Gene Networks derived from bio...[作者空间]
对某个物种进行分子进化分析,保守序列提取以及CRISPR-gRNA设计 基因组序列的获取 这里我们直接获取完整的基...[作者空间]
GRN:基因调控网络 分为四步进行GRN分析 1.GENIE3/GRNBoost:基于共表达情况鉴定每个TF的潜在...[作者空间]
Bioinformatics was like a box of chocolates. You never k...[作者空间]
1. 概念 转座元件是一类能改变其自身在基因组当中的位置的DNA重复序列,它能够使得突变产生,也能“逆转”已有突变...[作者空间]
今天看到别人介绍的一篇文章里出现了ChIRP-seq技术,猛一看眼熟,再一看,好吧,不认识,只是跟跟“熟人”长得像...[作者空间]
基因在从DNA变成蛋白的过程当中受到很多的调控的影响。其中主要包括:基因水平、转录水平、转录后水平、翻译水平和翻译...[作者空间]
1. Abstract 1.1 Background 在玉米中,低氮,低盐,干旱胁迫下的miRNA及其靶基因研究较...[作者空间]
ATAC-seq的基础概念 ATAC-seq(Assay for Transposase Accessible C...[作者空间]
No.1 :NCBI的Primer-Blast 推荐指数:五颗星 理由:这个工具整合了目前流行的Primer3软件...[作者空间]
Nat Rev Genet | 20 年来表观遗传领域核心进展之全景解读 原创: ppxu [Epigenetic...[作者空间]
对于我这种小白上路先来波概念吧!终于找到一个说人话的概念表观遗传学:在生物体中不是因为DNA序列的改变,而造成的可...[作者空间]
原文来源:Yang K, Wen X, Sablok G. Method for the Large-Scale ...[作者空间]
序列比对和序列特征分析总目录 启动子Promoter是位于基因5'端上游的DNA序列,调控基因表达。作用方式是通过...[作者空间]
序列比对和序列特征分析总目录 哺乳动物基因组中5%~10%是CpG(二核苷酸),若CpG聚集则称CpG岛,其中75...[作者空间]
CRISPR-PLANT 具体网址:https://www.genome.arizona.edu/crispr/i...[作者空间]
写在前面 以前总看到问题是,基因结构可视化的问题;现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单,也比较...[作者空间]