最近读到一篇博文，介绍了学习 RNAseq 数据分析非常推荐的两篇综述和七个在线教程并发表了相关评论。本文将进行简...[作者空间]
先提上昨天跑的程序的报错信息：这个是跑了一半之后，报错然后退出了 根据报错信息的提示：说是我的碱基信息和质量信息不...[作者空间]
前言：观看B站孟浩巍的系列视频2017-08-04-高通量测序技术交流录像，内容颇多，直接记录笔记代码，没有经过本...[作者空间]
给学徒的ATAC-seq数据实战 本次给学徒讲解的文章是 :The landscape of accessible...[作者空间]
先丢链接http://bioinformatics.sdstate.edu/idep/ 能做什么？可视化见过最全的...[作者空间]
首先安装软件 先安装conda，使用清华的conda，说明书：https://mirrors.tuna.tsing...[作者空间]
本文是# GATK4全基因组数据分析最佳实践,我以这篇文章为标志,终结当前WGS系列数据分析的流程主体问题 | 完...[作者空间]
统计差异基因数目 一些研究需要不止一个调整后的p值cutoff值。 为了对重要性进行更严格的定义，可能需要log-...[作者空间]
这是我根据之前的WGS系列和GATK4实践文章进行重新梳理之后确定下来的分析流程，这是一个WGS的最佳实践，它基于...[作者空间]
00 写在前面 一般公司会提供clean data和后续的基础分析结果。因为可能需要自己来进行数据的预处理，记得拿...[作者空间]
前言 在上一篇文章中我已经用例子仔细跟大家分享了WGS从原始数据到变异数据（Fastq->VCF）的具体执行过程。...[作者空间]
更新日期：2018/3/13 这里汇总一些生信分析和数据可视化相关的推文或笔记，为知笔记里存的东西太杂太乱，花了一...[作者空间]
前言 在前面的一系列WGS文章中，我讲述了很多基因数据分析的来龙去脉，虽然许多同学觉得很有帮助，但是却缺了一个重要...[作者空间]
经过了第四节的长文，我想大家基本上已经知道了一个WGS流程该如何构建起来了吧。但在那一节中限于篇幅有两个很重要的文...[作者空间]
这篇文章很长，超过1万字，是本系列中最重要的一篇，因为我并非只是在简单地告诉大家几条硬邦邦的操作命令。对于新手而言...[作者空间]
从这一节开始详细讲述正式流程的搭建，我将结合具体的例子努力争取将这个系列写成比GATK最佳实践更加具体、更具有实践...[作者空间]
在WGS数据的分析过程中，我们会接触到许多生物信息学/基因组学领域所特有的数据文件和它们特殊的格式，在这一节中将要...[作者空间]
前言 基因测序已是时下热门，目前除了华大基因之外，其他分布于全中国的大型测序平台（HiSeq X 10）还有约10...[作者空间]
