最近打算开始写一个多组学（包括宏基因组/16S/转录组/蛋白组/代谢组）关联分析的R包，避免重复造轮子，在开始之前...[作者空间]

刘小泽写于19.10.30经常使用R，势必会遇到一些好用的小函数，帮忙处理数据，这里就做一下整理 数据读取与基本操...[作者空间]

需求 使用snpEff软件对vcf格式文件进行注释后会生成一个snpEff_summary.html;这个文件是对...[作者空间]

这个需求真的太常见了！注意问题强调的几个关键词：一是快速，二是大量，三是差异明显。在生成大量元素比较图时要明显区分...[作者空间]

Circos图可以通过Circos官方下载。使用教程个人感觉R画出的图莫名的有种优越感。图片优美，数据衔接方便。可...[作者空间]

FGNet介绍   FGNet（Functional Gene Networks derived from bio...[作者空间]

原文英文链接：ChIP-Seq Workflow Template作者：Daniela Cassol (danie...[作者空间]

前言 R对windows使用很友好，对Linux来说充满了敌意。小数据可以在windows下交互操作，效果很好很棒...[作者空间]

示例 选iris来做pca分析示例，是因为他的分组间有差异，有研究意义去掉最后一列（分组信息） 看下热图 图1：碎...[作者空间]

如果只学习而不练习，那么你就会一种自己好像会了的错觉。为了打破这种错觉，你就需要实际的去练习，在实践中应用你学习的...[作者空间]

GEOquery包的getGEO函数总是无法下载肿么办 在生信技能树我发布的GEO数据库挖掘教程也有不少了：目录：...[作者空间]

目录 R语言之可视化①误差棒 R语言之可视化②点图 R语言之可视化③点图续 R语言之可视化④点韦恩图upsetR ...[作者空间]

生物信息分析中，接触最多的莫过于基因富集分析，故在此基础上目前已经开发了很多种富集分析工具，如网页版的DAVID、...[作者空间]

加载所需R包 设置工作路径 构建测试数据集 将热图结果按聚类后的顺序输出[作者空间]

提出情况下我们最好是在实验设计上就考虑到这一点。 但很多时候，数据分析者往往身不由己。 Stanford 大学 在...[作者空间]

箱线图 箱线图是能同时反映数据统计量和整体分布，又很漂亮的展示图。在2014年的Nature Method上有2篇...[作者空间]

主成分分析（Principal Component Analysis, PCA） 一个优秀的模型应该是用尽可能少的...[作者空间]

方差分析主要通过F检验来进行效果评测，若治疗方案的F检验显著，则说明检验样本组间均值不同。 ANOVA模型拟合 从...[作者空间]