构建进化树的方法主要分为 距离矩阵法（含 UPGMA、ME、NJ等） 最大简约法（MP） 极大似然法（ML） 贝叶...[作者空间]
以酿酒酵母为例，用到的数据如下，随便找一个链特异性测序的fastq用常见比对软件跑一下都行。有一些数据我放在git...[作者空间]
前言 PCR duplicate在NGS文库中是再常见不过的名词，对于需要自己建库的小伙伴来说可能会被折磨的“痛不...[作者空间]
前沿 最近参考了乳腺癌机器学习分类器文章，自己修改了下适合CRC结直肠癌病人肠道微生物的分类模型。具体可以到这里 ...[作者空间]
比如我现在需要表达FUS这个蛋白，首先我要确定FUS的CDS区序列，使用NCBI即可获得； 可以看出FUS有三个同...[作者空间]
本文首发于“生信大碗”公众号，转载请注明出处 之前我们讲了测序以及第一代测序技术，还没看的小伙伴可以先去补补课（你...[作者空间]
许多基因组的文章里都会提到使用PAML进行基因的正选择分析(positive selection), 网上也有一些...[作者空间]
这里总结了李宏毅老师的机器学习的课程。首先我们将会了解到机器学习的概念，但是课程的主要观点将会聚焦到Deep Le...[作者空间]
1. 背景 介绍 CRISPR的全称Clustered Regularly Interspaced Short P...[作者空间]
GO分析（上下调基因分开做，可用于BP,CC,MF分开画图） GO分析（上下调一起做，强烈推荐，可以看整体结果，并...[作者空间]
目前我们主要分析的数据还是二代测序的数据，也就是大家经常挂在嘴边的 NGS，而这其中最大的赢家应该算是 illum...[作者空间]
论文是 Environmental factors shaping the gut microbiome in a...[作者空间]
下载 网址：http://www.htslib.org/download/[http://www.htslib.o...[作者空间]
为什么没有（四）？（四）主要说的就是SAM格式，网上一搜就有，就没必要了（五）就草草地记录了Chapter 4.1...[作者空间]
局部比对算法 —— Smith-Waterman Algorithm Swimt-Waterman算法本质上是一种...[作者空间]
一、基本操作 1. 使用界面 可以注册后使用，点击upload即可上传树文件 2. 基本操作 右侧controls...[作者空间]
最近写的文章，朋友过目后提出的问题让我自己感觉到本科阶段的学习没有做一个非常好的总结，应付完考试之后，早已忘到九霄...[作者空间]
第一部分 —— 关于计算生物学 & 生物信息学 & 本课程内容 （1）Protein Wave 【技术】Sange...[作者空间]
单细胞测序方法和原理系列： 1. 单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[...[作者空间]
Fundamentals of Bioinformatics and Genomics ?TO-DO?? 生物信息...[作者空间]
