Part1 数据下载 先去Korean Personal Genome Project下载了编号为KPGP-00...[作者空间]
将文件的后缀名进行批量修改将要修改的文件复制到一个新的文件夹中,然后在这个文件夹中新建一个文本文件,在其中输入 保...[作者空间]
排序 从vcf文件排序开始,可以使用picard,也可以使用vcftools 的vcf-sort vcf转换为pe...[作者空间]
tasselplinkvcftools vcftools的帮助文档 GAPITGEMMAFARMCPULDAKst...[作者空间]
hapmap format (.hmp) ped(.ped) map(.map) bed(.bed) 参考:Bas...[作者空间]
此qq图和腾讯的qq图不是同一个东西啦,这个qq图是对数据的分布情况的统计检验,下面简单介绍一下qq图的原理 我的...[作者空间]
可以使用haploview进行计算LD衰减值和画单倍型块图块,这个软件可以输入多种不同的文件格式:Linkage ...[作者空间]
首先安装软件 先安装conda,使用清华的conda,说明书:https://mirrors.tuna.tsing...[作者空间]
继续上一节课教程的下半节,继续介绍一些其他过滤SNP的工具,欢迎大家跟着学习。 从现在开始,过滤步骤假定vcf文件...[作者空间]
前言 很多关注我这个专题的朋友都在后台留言,说想了解更多关于SNP过滤的东西。是的,确实这是一个比较重要的问题。第...[作者空间]
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bedtools等工具号称是可以代替普通的生物信息学数据处理工程师的!我这里用一个专题来讲解它的用法,其实它能实现...[作者空间]
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欢迎关注"生信修炼手册"! dbSNP是NCBI中专门用于存储物种SNP位点信息的数据库,网址如下 http://...[作者空间]
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