本次推送是文献分享22的对应内容。我与生信,公众号:我与生信文献分享22:泛基因组解析柑橘亚科进化以及柑橘果实中柠...[作者空间]
标题:tsRNA分类分析:seqac包 tRNA的二级结构如下: 根据其二级结构,tsRNA分类如下: 早期研究报...[作者空间]
本期内容为[跟着NC做基因组数据分析],这是你需要的教程,对你一定有帮助。 前言今天花费找文章,看到一篇关于基因组...[作者空间]
自己在参考大牛的基础上,总结了RNAseq比对流程pipeline脚本。在做好前期准备工作后,可以一步完成从fas...[作者空间]
写这篇文章一部分原因是填2年前的一个坑 转录组入门(7):差异表达分析. 另一部分原因是GQ最近又在搞一波无重复...[作者空间]
1 获取文章数据 1.1 获得文章数据地址 AKAP95 regulates splicing through s...[作者空间]
参考1参考2我试了其中一个方法:[作者空间]
ComBat-seq:使用经验贝叶斯框架调整批处理效果输入raw_count 文件,输出也是count 文件安装(...[作者空间]
在《Salmon 进行转录本定量》文章介绍了 Salmon 定量。定量后将数据导入 DESeq2 官网有简单的 t...[作者空间]
写在前面 转录组通常被用来寻找差异基因,但是有的时候我们想看一下已报道的基因是否存在可变剪切现象,即新转录本的挖掘...[作者空间]
用到CORNAS是因为我拿到了没有重复的样本,想和GFOLD对比一下有何不同详见这篇:我的GFOLD摸索 其实很简...[作者空间]
刘小泽写于2020.2.20常见的差异分析第一步往往是去进行标准化处理,那么究竟标准化的对象是什么?怎么根据具体情...[作者空间]
每月一生信流程栏目灵感来自于《铁汉1991》博客的《每日一生信》,他那个时候介绍的主要是生信基础知识,包括数据结构...[作者空间]
这次在新的服务器上安装gfold的时候,偶然发现GFOLD的官网已经404了,于是索性就conda一套进行安装co...[作者空间]
我们之前已经介绍过如何《使用xcell根据表达谱推断样本组成细胞的类型》,具体思路就是根据已知细胞系的表达谱,计算...[作者空间]
Davey1369852697@qq.com2019/10/9 ▼更多精彩推荐,请关注我们▼[作者空间]
暴躁版 制约我们的是热情吗?是知识吗? 不,是网速啊,阿西吧! 1 获取SRA号——自己读文献,去pubmend搜...[作者空间]
太长不看版本 DESeq 最新版本(v1.25.9)针对大样本分析的速度和之前相比有了质的飞越,果子老师的 121...[作者空间]
参考基因组下载有三大全文网站提供参考基因组下载,它们分别是:1.NCBI (https://www.ncbi.nl...[作者空间]
懒癌的我全靠Jimmy催着学习,4月份答应交这份作业的,离中间被催又过了一个多月,今天完成啦。 数据来源: 拟南芥...[作者空间]