全基因组甲基化测序(WGBS)是一种研究DNA甲基化的方法，以全面了解在基因组水平上的表观遗传变化。在进行WGBS...[作者空间]
单细胞大多数东西我都不是那么想写，因为就是照着流程抄。而且写的人挺多的了，不差我一个。但是最近谷歌了一下cellr...[作者空间]
作者，Evil Genius 疫情真的是严重啊，北京健康宝继续弹窗，但是，不影响大家好好看文献，做科研。 在上一篇...[作者空间]
转座子数据库 上一篇《TEtranscripts：转座子元件差异表达[https://mp.weixin.qq...[作者空间]
这里是佳奥！新的篇章！ 我们先从背景知识开始。 1 miRBase探索 miRBase数据库收录miRNA序列： ...[作者空间]
这里是佳奥！ 获得了peaks之后我们导入IGV检查。 1 deeptools初探 bamCoverage的基本用...[作者空间]
这里是佳奥！ 获得了比对的bam文件，生成了index的bai文件，生成了比对结果stat文件。 合并bam文件和...[作者空间]
1、starBase 一个高通量实验数据CLIP-Seq（或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP）...[作者空间]
IGV软件有自带的基因组文件和注释文件，使用自带的还是方便一些。但是，其使用的注释文件和基因组文件可能与我们数据分...[作者空间]
GSVA 也是 SCI 文章中常见的分析方法，在我们获得多个pathway的时候，可以比较pathway在样本分组...[作者空间]
最近比较忙，所以有段时间没有更新了，后面多多更新，再补过来! 之前整理了关于热图的绘图代码，包括常规热图，和个性化...[作者空间]
相信很多小伙伴在看miRNA相关的paper中都看到过如下图所示的miRNA成熟体序列和靶基因的序列比对结果。 那...[作者空间]
1.1 Linux下指定R包的安装路径 export R_LIBS_USER = /your/path/sourc...[作者空间]
2.1 准备表型数据 第一行是表头，第一列是个体号，其余每一列一个表型，Tab键分隔。 2.2 准备基因型数据 可...[作者空间]
笔记主要内容：1~3代测序技术，fastq文件 & FASTQC （1）测序技术 1、一代测序技术：Sanger ...[作者空间]
自己在参考大牛的基础上，总结了RNAseq比对流程pipeline脚本。在做好前期准备工作后，可以一步完成从fas...[作者空间]
1.正义链/反义链定义 2.正负链 定义 3.两种定义的区分 正义链/反义链 定义： mRNA转录时结合的那条...[作者空间]
最近导师push的比较紧，没有时间来做更新。（懂的都懂，谁都不想在组会上享受社会性死亡） 今天来分享一下单细胞3'...[作者空间]
写在前面 最近分析的物种由于国外品种与国内品种差异还是比较大，虽然大部分文章用的参考基因组都是以国外品种为主，但是...[作者空间]
