在组装未知基因组时,往往需要利用重测序数据提前进行基因组调查,以获取其基因组规模,杂合率,重复序列比例,GC含量等...[作者空间]
最近在搞基因组,前面contig的组装难度不大,用wtdbg2、raven、mecat2、flye等组装就可以了。...[作者空间]
1. 主要纠错类型 上篇HiC挂载软件以及如何用Juice_box手工纠错?[https://www.jiansh...[作者空间]
1.常用HiC挂载软件 ALLHiC张兴坦老师专为多倍体和高杂合度物种基因组挂载开发。如果是复杂基因组,肯定是首选...[作者空间]
系统进化树学习笔记。 系统进化树简介 系统进化树(Phylogenetic tree):用一种类似树状分支图形来概...[作者空间]
https://bioconductor.org/packages/devel/bioc/vignettes/gg...[作者空间]
这套流程主要特点是消耗资源比较少,1G以内的基因组,内存不要低于128G,最好能搞到256G,但是再多对这套流程用...[作者空间]
笔者试了几天,死活装不上PASA,几乎绝望了,幸好在PASA的官网上发现可以用docker来安装,太高兴了。貌似国...[作者空间]
目前实时荧光定量PCR已得到广泛应用,如:扩增特异性分析、基因定量分析、基因分型、SNP分析等......荧光定量...[作者空间]
参考视频:https://www.bilibili.com/video/BV1LK411M7nZ?from=sea...[作者空间]
基本awk和sed命令 从文件中提取2,4,5列: 输出第五列中包含abc123的行: 输出第五列中不包含abc1...[作者空间]
作者:May审稿:童蒙编辑:amethyst 引言 大家好,又到了阿拉丁聊基因组的时间了。今天我们按照上期的计划,...[作者空间]
很多人想学习R语言绘图,最好的办法就是多进行操作,这里有一个非常好的网站,里面汇集了大量R语言的绘图代码,只需将这...[作者空间]
作者:云歌审稿:童蒙编辑:angelica 引言 以PacBio公司SMRT技术为代表的第三代单分子荧光测序平台为...[作者空间]
流程主要参考https://www.jianshu.com/p/859c0345624c[https://www....[作者空间]
基础流程(cellranger)(细胞管理员) cellranger 数据拆分 cellranger mkfast...[作者空间]
分类 转座元件,是一种跳跃基因,是指一段DNA序列由基因组的一个位置跳跃到另一个位置,由Barbara McCli...[作者空间]
应用单细胞测序技术研究科学问题越来越普遍,当下应用最火热的是10X Genomics公司的解决方案,但是在某些特殊...[作者空间]
写在前面 很久以前,我们推出《热图,还只会用方格子?@所有人,论文热图升阶的时候到了!》这一功能。目前已有一定的用...[作者空间]
备注知识: 还是要参见R的官方网站 http://cran.stat.ucla.edu/bin/linux/ubu...[作者空间]