今天查看gwas-catalog网站,发现即将推出GWAS 汇总统计数据的新格式GWAS-SSF[https://...[作者空间]
全基因组关联研究(GWAS)为复杂疾病的遗传基础提供了见解。在下一步中,综合多组学方法可以表征相关原发组织中的分子...[作者空间]
ssGBLUP经过10多年的发展,已经普遍开始应用在动物育种中。 以前的多步法 基因组评估 问题: 表型的测量 B...[作者空间]
作者:Resther审稿:童蒙编辑:angelica 什么是TWAS 对GWAS(genome-wide asso...[作者空间]
“前言: 如何安装软件?博主你是来搞笑撑版面的吗? 大神请飘过~~ 高兴点个赞就好~ 小白们不要告诉我双击打开,我...[作者空间]
Kang HM, Sul JH, Service SK, et al. Variance component mo...[作者空间]
Chang H-X, Brown PJ, Lipka AE, et al. Genome-wide associa...[作者空间]
1、基本统计学概念 假设检验• 零假设(H0):即原假设• 备择假设(H1):与零假设对立的假设• 计算零假设(H...[作者空间]
1、群体结构及其对 GWAS 的影响 群体结构的来源image.png群体结构对GWAS的影响--混淆变量Ance...[作者空间]
1、GWAS 流程 image.png数据质控• 1)按分型百分比条件过滤,多数文章剔除缺失率在20%以上的位点,...[作者空间]
在硕士就读期间,就已经做过 GWAS 相关的分析。当时标记量非常少, windows 系统分析就足够了,作图方面涉...[作者空间]
背景 群体遗传学中测出很多个个体,得到了最终的SNP vcf文件,需要将其分成群体,看哪几个物种聚在一起。一般使用...[作者空间]
在植物的QTL定位最后阶段,会把QTL定位到一个很小的区间,这里面可能有几个候选基因,如何进行下一步的分析是个很头...[作者空间]
一个群体在理想情况(不受特定的干扰因素影响,如非随机交配、选择、迁移、突变或群体大小有限),经过多个世代,基因频率...[作者空间]
tassel需要Java环境 downloads tassel_5 添加到环境变量中 命令行的tassel有很多的...[作者空间]
tasselplinkvcftools vcftools的帮助文档 GAPITGEMMAFARMCPULDAKst...[作者空间]
欢迎关注"生信修炼手册"! haploview 是基于图形界面的软件,其界面设计良好,用法简单,是进行连锁不平衡分...[作者空间]
前言 很多关注我这个专题的朋友都在后台留言,说想了解更多关于SNP过滤的东西。是的,确实这是一个比较重要的问题。第...[作者空间]
1. 软件准备 2. 使用TASSEL 软件进行基因填补 打开tassel 软件 导入数据用KNN填补(Imput...[作者空间]
基本概念 图谱应用 构建流程 QTL定位 Q&A[作者空间]