如图: Github: https://github.com/leekgroup/networks_correct...[作者空间]
最近在NAR上看到一篇文章: 原文网络图如下: 我们借此机会,通过ggraph作图解析相关参数。详细注释代码和参数...[作者空间]
manlius/muxViz: Analysis and Visualization of Interconnec...[作者空间]
加载工具包 加载数据 定义一些颜色 筛选优势物种 构建函数计算相关性和共现性网络 运行函数,生成结果 输出结果,在...[作者空间]
scWGCNA是一个生物信息学工作流程,是R包WGCNA[https://horvath.genetics.ucl...[作者空间]
今年三月份南京航空航天大学姜维老师团队发表在Molecular Therapy Nucleic Acids(8.8...[作者空间]
40. 网络图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用igraph包绘制网络图 使用ggraph包绘制网络图...[作者空间]
visNetwork是一个用于网络可视化的R包,使用的是vis.js javascript库(http://vis...[作者空间]
可视化数据时,网络可以很好展示各个节点之间的关系以及关系的重要性。网络中存在大量的节点和边,因此绘制一个好的网络会...[作者空间]
N久没有更新了,最近一段时间有点繁忙。今天,一起来学习一下一个和Circo图差不多的图:Edge Bunding图...[作者空间]
在网上随意浏览的时候,无意间发现另一种可以构建调控网络的软件,叫做GENIE3。这是一个R包,直接在R里运行。这款...[作者空间]
之前我们介绍了一项整合多维组学通路分析的工作ActivePathways,能够在多个数据集中识别到显著富集的通路,...[作者空间]
https://academic.oup.com/bib/article/19/4/575/2888441boot...[作者空间]
鉴于大量的转录组数据,可能出现的一个问题是“如果A组和B组都进行了转录组研究并报告了一些结果,这些结果的相容性如何...[作者空间]
综述 经典的WGCNA分析用于疾病两组比较的MEGENA用于两组处理比较的DGCA整合工具CEMiToolCEMi...[作者空间]
Nov 21, 2019更新 => 修正部分function代码,实现了导出gene2module 目的 最...[作者空间]
需求描述 cytoscape里面默认的node只能分配一个颜色。想要对每个node在某一份组当中的具体的值。类似这...[作者空间]
表达谱数据分析的时候,经常包括各种各样的分析。比如差异表达分析,富集分析,GSEA,蛋白相互作用分析等等等等。Ne...[作者空间]
WGCNA(Weighted Correlation Network analysis)是一个基于基因表达数据,构...[作者空间]
一、研究背景 miRNA,TF 都能调控基因的表达,TF 影响 mRNA 的转录过程,miRNA 通过降解 mRN...[作者空间]