在实验室经常听到师兄师姐评估基因组提到一个点就是,基因组能拼成圈吗,当时还是生信小白(现在是个资深小白)的我仅仅见...[作者空间]
开篇废话一下:> 这篇日志分享的实际上是我总结了NCBI基因组上传流程并分享给组内同学参考的PPT教程,当然我们P...[作者空间]
?这篇写得太久了,还有很多不满意的地方,决定先放出来再慢慢完善。刚来实验室的那会儿,经常听到实验室的师兄说建库,p...[作者空间]
写在前言,虽然笔主真的很喜欢几行命令行就能解决很多重复劳动,但本人还是被傻瓜式软件吃得死死的,哎真香。在此介绍一下...[作者空间]
最近AlphaFold2开源了,然后另一个灵感来自AlphaFold的RobeTTaFold[https://ro...[作者空间]
感觉啥都能用代码敲就很棒啊,期待明年此时在文本上面的编辑已经完全脱离鼠标,此篇记录一下代码编辑笔记的日常 语法规则...[作者空间]
前言背景前段时间重装系统Anaconda全没了,重装了之后就没咋管过,直到最近要用到Roary,conda con...[作者空间]
前言 兴高采烈地照着书本打算稳扎稳打过一遍zika RNA-seq这一篇分析,结果一上来就频频报错。 平台: Ma...[作者空间]
使用软件:barrnap(需要在合适的环境中配合运行) barrnap其实 除了自己一个文件以外,还会配合bedt...[作者空间]
前言 最近在跑一个很大的数据集,大概有3500条以上的基因序列,因为数量太大,跑树有点搞不定,特此来记录一下这个过...[作者空间]
脚本的出错 打开一比对结果发现报错了!说是第四十一行多了个括号 打开看一下41行长什么样子Screenshot 2...[作者空间]
所以理论跟实践又是另外一回事了!!!! MacOS 上运行zcat结果出现了zcat: can't stat: p...[作者空间]
平台:MacOS,系统:Catalina 初次使用刚装上开箱后就用 结果出现了上图的报错,查找了官网发现,原来还需...[作者空间]
*上面由gbk文件中提取出来的信息如下图所示 包含的信息有:1.locus_tag,2.protein_id (可...[作者空间]
EGGNOG-MAPPER批量注释 其实使用的是一个for循环 以上为今天使用的Eggnog-mapper的记录 ...[作者空间]