2023年中国农业科学院油料作物研究所刘胜毅老师课题组发表在Plant Communications杂志上的一篇文...[作者空间]
推文的代码主要来源于论文 A reference-unbiased super-pangenome of the ...[作者空间]
环境 测试 1构建泛基因组 2 reads比对到泛基因组[作者空间]
EUPAN主程序 EUPAN-lib文件目录： 安装链接：Installation (sjtu.edu.cn)[h...[作者空间]
近日，人类泛基因组参考联盟（HPRC）在《Nature》杂志上发表了《人类泛基因组草图》。相较于我们常用的GRCh...[作者空间]
将同一属内不同种遗传变异的泛基因组整合在一起构建的超级泛基因组可以更好地代表整个属的遗传变异。稻属包括亚洲栽培稻 ...[作者空间]
论文 Chromosome-level assemblies of multiple Arabidopsis ge...[作者空间]
转载自-诺禾致源-知乎 从提出人类基因组计划发展至今，已经超过了20年。目前，一个物种参考基因组的构建，往往是选取...[作者空间]
准备 1.基因组序列下载与注释，使用prokka进行注释，获得gff文件。参考我前一篇：autoprokka:使用...[作者空间]
导读 全基因组关联研究中遗传力缺失是复杂生物性状遗传分析面临的一个主要问题。解决这个问题的办法是找出所有的因果遗传...[作者空间]
https://mp.weixin.qq.com/s/eZbMdVE-BRVRXC3SxmY3fw[https:/...[作者空间]
泛基因组概念 泛基因组是指一个生物分支（物种）的全部基因信息，可以分为由所有个体共享的核心基因和由部分个体共享或者...[作者空间]
Hortic Res | 武汉大学李家儒：盾叶薯蓣高质量基因组解析与薯蓣皂苷生物合成进化[https://mp.w...[作者空间]
2022年7月，刘仁义团队（福建农林大学）和张兴坦团队（福建农林大学/中国农科院深圳农业基因组研究所）在Horti...[作者空间]
Genome-wide DNA methylation profiling and identification ...[作者空间]
经历过OrthoMCL软件包安装的艰辛（然而，终究也没安装成功），就知道转而用BPGA包是有多么香了。话不多说，来...[作者空间]
研究人员正在创建一个体现全人类基因变化的人类“泛基因组”，然而不是每个人都想参与。 几年前，美国华盛顿大学的遗传学...[作者空间]
前言 在发表文章之前我们需要将测序的原始数据上传到一个公共库，并在文中提供accession number，实现数...[作者空间]
四个环境gtdbtk、pangenome、minigraph、drep、metawrap-env gtdbtk可...[作者空间]
介绍 泛癌分析 我们都知道在TCGA数据库[https://cloud.tencent.com/solution/...[作者空间]
