批量测序实验(单组学和多组学)对于探索广泛的生物学问题至关重要。为了促进交互式、探索性任务以及共享易于访问的信息,...[作者空间]
今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程,适用于初学者入门阅读,从原始测序数据开始,经过质控、序列比对、定量表达...[作者空间]
学习目标 了解 RNA-seq count 数据的特征 比较 count 数据的不同数学模型 确定最适合 RNA-...[作者空间]
学习目标 了解 RNA-seq 和差异表达基因的分析流程 了解如何设计实验 了解如何使用 R 语言进行数据分析 1...[作者空间]
外科手术是实体肿瘤的一线治疗手段。然而,据不完全统计,高达30%-40%的癌症患者在术后5年内发生复发或转移,并且...[作者空间]
单细胞转录谱可以根据基因表达水平进行差异分析,通过差异分析,我们可以知道不同分群之间是否存在差异,以及存在显著表达...[作者空间]
前言 康奈尔大学,FeiLab的一个预测工具。 iTAK 是依赖于数据库的用于从蛋白质或核苷酸序列中识别植物转录因...[作者空间]
如果所研究的物种有组装注释质量较好基因组序列,且和该基因组序列比对效率较高,那么可以采用有参转录组的分析策略,直接...[作者空间]
(十)、分析流程及软件列表 有参转录组:针对有参考基因组序列的物种进行 mRNA 的分析。 无参转录组:针对尚无参...[作者空间]
外泌体和微囊泡是几乎所有类型的细胞都能释放的细胞外囊泡(ev)的两大类,在生物液体中非常丰富,ev的分子组成和释放...[作者空间]
文章目的:前列腺癌细胞可以释放细胞外囊泡到胞外环境中并且可以在尿液中被检测到,文章对9个前列腺癌病人与4个正常男性...[作者空间]
(五)比对相关 blast:Basic Local Alignment Search Tool,一种序列比对的工具...[作者空间]
一、基本概念 RNA-seq即转录组测序[https://baike.baidu.com/item/%E8%BD%...[作者空间]
TITLE :Genome-wide methylation and expression analyses re...[作者空间]
文章题目:Identification of the interaction network of hub gen...[作者空间]
论文 Microbiome differential abundance methods produce diff...[作者空间]
为什么没有(四)?(四)主要说的就是SAM格式,网上一搜就有,就没必要了(五)就草草地记录了Chapter 4.1...[作者空间]
差异基因筛选的常见方法有edgeR, DEseq2, EBseq等,这篇文章主要介绍DEseq2。 官方网站:ht...[作者空间]
基因芯片 vs RNA-seq哪个好 ? 最近几年二代测序(又叫NGS)很火,而且价格越来越便宜,原来都用芯片检测...[作者空间]