看了一圈,好像没有环状RNA分析的下游 CircRNAprofiler 是一个基于 R 的框架,只需要 R 安装,...[作者空间]
周一小编为大家分享了一篇circRNA理论知识点的paper(?circRNA在癌症和肿瘤学中的新作用[http:...[作者空间]
环形RNA是一类在真核生物中广泛存在的具有特殊环状结构的非编码RNA分子。已有文献表明,在生物体内,环形RNA有着...[作者空间]
circRNA的生信分析根据鉴定的方法不同可以分为以下两种: split-alignment-based appr...[作者空间]
今天测试另一个环状RNA预测的重要软件——CIRCexplorer2。该软件是由中国科学院上海生命科学研究院生物化...[作者空间]
Find_circ工具是最早利用高通量测序数据预测环状RNA的开山鼻祖。该工具是Memczak等人2013年在权威...[作者空间]
通过spliced reads的mapping能发现线性RNA和环状RNA的剪切方式不同。一个是正常的5’/3’前...[作者空间]
cirRNA是非编码RNA中的一大类,它由一种非经典剪接方式——反向剪接(backsplicing)产生;当反向剪...[作者空间]
Classifying gastric cancer using FLORA reveals clinically...[作者空间]
随着对人类疾病和生物过程的研究,从实验测序产生了大量的功能性lncRNA集合。虽然目前已开发多个lncRNA数据库...[作者空间]
前言 今天来跟大家分享一个smallRNA的分析流程——sRNAnalyzer[http://srnanaly...[作者空间]
ENCORI(The Encyclopedia of RNA Interactomes,http://starba...[作者空间]
前言:这个帖子本应该在2018年就要写完的,有个网友甚至当时加了我微信给了50块钱我都没有给他一个代码版。在这里希...[作者空间]
最近在看ceRNA的时候看到了一个宝藏R包,写包简化了芯片数据下游分析之后,我正想着写转录组下游分析的简化版,就看...[作者空间]
Accurate quantification of circular RNAs identifies exte...[作者空间]
论文 GDCRNATools: an R/Bioconductor package for integrative...[作者空间]
文章2017年发表在Oncotarget上(虽然已经牺牲了),但是我们可以取其精华呀,只要还有值得我们学习的地方,...[作者空间]
参考0参考1miRNA预测工具miRDeep-P2简明教程植物miRNA靶基因预测下机数据整理汇总find -na...[作者空间]
简单回顾一下19年 circRNA 报道的大事件(CELL合集) 2019年2月7日 (农历己亥年正月初三) 首篇...[作者空间]
往日都是对Mus 基因表达探针进行重注释,今日遇到了对大鼠表达探针进行重注释,但是在往日的分析中很少遇到Rattu...[作者空间]