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环状RNA分析下游

环状RNA分析下游

作者: 可能性之兽 | 来源:发表于2022-09-07 12:40 被阅读0次

    看了一圈,好像没有环状RNA分析的下游

    CircRNAprofiler 是一个基于 R 的框架,只需要 R 安装,并提供15个模块,用于对 circRNA 进行全面的计算机分析。这个计算框架允许组合和分析以前由多个公开可用的基于注释的 circRNA 检测工具检测到的 circRNA。它涵盖了 circRNA 分析的不同方面,从差异表达分析,进化保守性,生物发生到功能分析。CircRNAprofiler 使用的管道是高度自动化和可定制的。此外,circrNAprofiler 还包括一些额外的数据可视化功能,有助于解释结果。

    circRNAprofiler: An R-based computational framework for the downstream analysis of circular RNAs (bioconductor.org)

    image.png
    library(circRNAprofiler)
    
    # Packages needed for the vignettes
    library(ggpubr)
    library(ggplot2)
    library(VennDiagram)
    library(gridExtra)
    

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