GWAS，全基因组关联分析
根据使用的表型不同可以分为下面的不同种类的GWAS:
普通的表型（株高、产量、叶夹角、叶面积）：GWAS
使用转录组测序，把基因的表达量作为表型：eGWAS
使用代谢物测序，把各种代谢物的表达量作为表型：mGWAS
MWAS: metabolome-wide association study 宏基因组（微生物）关联分析，
TWAS的原理示意图：
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TWAS分为三步:
- 第一步，基于reference panel来建模，构建SNP和基因表达量之间的关系。reference panel中的样本同时拥有基因分型和表达量的结果，根据距离确定基因对应的SNP位点，比如选择基因上下游500kb或者1M范围内的SNP位点，拟合这些SNP位点和基因表达量之间的关系
- 第二步，用第一步建模的结果来预测另外一个队列的基因表达量，这个队列中的样本量只有GWAS结果，称之为gwas cohort， 这一步可以看做是对gwas cohort中的基因表达量进行填充
- 第三步，用填充之后的基因表达量来分析基因和性状之间的关联
关于TWAS更多信息阅读：https://www.jianshu.com/p/4da12a765d21
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