可以使用 R 包 TCGAbiolinks 来获取 TCGA 癌症临床信息
if (!requireNamespace("BiocManager",quietly=TRUE)){
install.packages("BiocManager")
}
BiocManager.install("TCGAbiolinks")
install.packages("openxlsx")
library(TCGAbiolinks)
library(openxlsx)
projects=getGDCprojects()
write.xlsx(file="projects.xlsx",projects,rowNames=F)
信息保存在projects.xlsx文件中，查看projects.xlsx (部分内容预览)：
我保存好了，也可以直接下载：https://www.jianshu.com/p/3187b8d336a6
image.png
可以使用 R 包 TCGAbiolinks 来获取 TCGA 癌症临床信息 信息保存在projects.xlsx文...
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本文标题：R包TCGAbiolinks获取TCGA所有projects的信
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