美文网首页
R包TCGAbiolinks获取TCGA所有projects的信

R包TCGAbiolinks获取TCGA所有projects的信

作者: 小霖123 | 来源:发表于2022-09-08 11:19 被阅读0次

    可以使用 R 包 TCGAbiolinks 来获取 TCGA 癌症临床信息

    if (!requireNamespace("BiocManager",quietly=TRUE)){
        install.packages("BiocManager")
     }
    BiocManager.install("TCGAbiolinks")
    install.packages("openxlsx")
    library(TCGAbiolinks)
    library(openxlsx)
    projects=getGDCprojects()
    write.xlsx(file="projects.xlsx",projects,rowNames=F)
    

    信息保存在projects.xlsx文件中,查看projects.xlsx (部分内容预览):
    我保存好了,也可以直接下载:https://www.jianshu.com/p/3187b8d336a6

    image.png

    相关文章

      网友评论

          本文标题:R包TCGAbiolinks获取TCGA所有projects的信

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/afqonrtx.html