Conda管理多个版本的R, python

image.png

Conda是一个非常好用的工具，既可以管理packages，也可以管理和下载软件，还可以建立多个虚拟环境来独立运行多个版本的软件。conda分为anaconda和miniconda。anaconda是包含一些常用包,miniconda是精简版。做生信常常用的一些包只支持老版本的R，一些新开发的包又只支持最新的R，这里我们用conda建立多个版本的R环境。
conda的安装：
下载地址：https://www.anaconda.com/distribution/
https://docs.anaconda.com/anaconda/install/

查看是否安装conda，从终端输入

conda --version
#或者
which conda

如果安装了的话，会显示现在所用的版本等信息，没有的话，可以下载安装，安装好了别忘记配置环境变量。

# 以anaconda3为例：
echo 'export PATH="~/anaconda3/bin:$PATH"' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc

环境创建：conda create -n new_env(环境名）
环境的查看：

conda env list

如需要安装特定版本的软件:

conda install 软件名=版本号

最新Python的安装：

conda create -n py37 python=3.7
#或者
conda  create  --name  python37   python=3.7

进入python 3.7 环境：

conda activate py37
#或者
source activate py37

退出环境：

conda deactivate
#或者
source deactivate py37

创建不同版本R环境：

conda create -n r36 r=3.6

安装特定版本R

conda install -c r r=3.6
#或
conda install r=3.6

conda来安装R的packages
https://docs.anaconda.com/anaconda/packages/r-language-pkg-docs/

conda install -c r r-dplyr

查看已创建的环境：

conda info --envs
#或者
conda env list

最后不需要的环境需要移除的话：

conda remove -n py27 --all

复制一个环境：

conda create -n newenv --clone py27

查看conda安装的包：

conda list

删除已安装的软件或者包：

conda remove -n 环境名 软件名
#卸载指定软件:
conda remove 软件名

更新某个软件:

conda update 软件名

参考：
https://www.jianshu.com/p/edaa744ea47d
https://www.jianshu.com/p/2f3be7781451
https://www.jianshu.com/p/17288627b994
https://zhuanlan.zhihu.com/p/46902996
https://blog.csdn.net/ITLearnHall/article/details/81708148

欢迎关注～

Conda管理多个版本的R, python