R语言
1.下载R和Rstudio
2.R语言的基本操作
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/a2c292a520f79c2a.png)
1画图
plot是图,rnorm是正态分布的函数
plot(rnorm(50))
点状图
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/2dffe8f898b16bd9.png)
boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))
箱线图![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/2c44b826723bffc8.png)
iris是R语言自带的数据库,iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据
2 R语言工作目录
引自生信星球
R语言只能在一个文件夹下进行工作
设置工作目录:setwd()
查看工作目录:getwd()
可以用project建立多个工作目录
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打开Rstudio,
project是绑定文件夹的。弹出的窗口问你是新建一个文件夹还是使用已经存在的文件夹。我们以新建为例:
填好文件夹名后,(其实给文件夹命名了,也就等于给project命名了,二者同名)点击Create Project,就打开了一个新的session,不干扰你目前正在进行的项目噢。
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2.打开Rproject
打开这个项目后,用getwd()查看一下,就会发现你的工作目录就是Rproject所在的目录啦。
生信技能树创始人jimmy推荐,只用这一个方法打开Rstudio。那么下次再要打开这个项目时,只需要在文件夹中找到这个R project,双击打开即可。
从此管理多个项目不成问题咯。
你用到的同一个项目的脚本/数据全都默认放在这里。
3 R语言操作
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/b4f3322760b36f03.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/0282342d6b9dd214.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/68aa40477f87aa39.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/a7754d7ad1f027d4.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/f54fbd17b22b54db.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/a2e3c7ce9597061f.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/efe0e7c26d4aabd8.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/01baf51aa941a277.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/cbb308ae9bfed775.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/50f496e2b5254511.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/e33aff5d401a2b62.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/f61436d0c2503326.png)
1.安装包,install.packages(“包”)
2.下载好安装包,在本地安装tool-install packages
3.Bioconductor进行安装
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/fda13817529f1f0e.png)
总结
![](https://img.haomeiwen.com/i12617751/5978cfc4028fbb20.png)
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