学习小组Day3笔记--LA

作者: 黑森林深处的小星星 | 来源:发表于2020-03-23 00:37 被阅读0次

1.conda镜像的安装

conda是用于下载APP的linux软件,miniconda就足够我们使用了

  • 1 进入conda的网站https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
  • 2 根据服务器的版本进行选择,运行uname -a
  • 3 cd 安装的文件夹,运行wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
  • 4 激活conda source ~/.bashrc
  • 5 验证conda出现这个就成功了 image.png
  • 5镜像,相当于主网站的副本,conda在国外,我们国内安装镜像会加快软件的下载速度。清华镜像和中科大镜像。
# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

2.软件的安装

  • 1conda list查看所有软件列表
    conda search fastqc查找软件fastqc。
  • 2 conda install fastqc -y自动安装软件
  • 3 conda remove fastqc -y
  • 4 删除minicondarm -rf ~/miniconda3,环境变量中去掉conda

总结

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