学习小组Day3笔记--LA

作者: 黑森林深处的小星星 | 来源:发表于2020-03-23 00:37 被阅读0次

    1.conda镜像的安装

    conda是用于下载APP的linux软件,miniconda就足够我们使用了

    • 1 进入conda的网站https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
    • 2 根据服务器的版本进行选择,运行uname -a
    • 3 cd 安装的文件夹,运行wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
    • 4 激活conda source ~/.bashrc
    • 5 验证conda出现这个就成功了 image.png
    • 5镜像,相当于主网站的副本,conda在国外,我们国内安装镜像会加快软件的下载速度。清华镜像和中科大镜像。
    # 使用清华镜像
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
    conda config --set show_channel_urls yes
    

    2.软件的安装

    • 1conda list查看所有软件列表
      conda search fastqc查找软件fastqc。
    • 2 conda install fastqc -y自动安装软件
    • 3 conda remove fastqc -y
    • 4 删除minicondarm -rf ~/miniconda3,环境变量中去掉conda

    总结

    image.png

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