今天学习了Linux环境下软件的安装,先上思维导图:

在Windows系统中,软件安装是在其应用商店搜索软件,再下载安装。那么在Linux小企鹅中,conda就扮演Windows中应用商店这一角色,接下来总结一下linux中的软件下载安装:
1. miniconda3的下载安装和激活
下载:wget 下载链接

安装:bash 脚本名
激活:source ~/.bashrc

2. 查看conda内的软件列表:conda list

3. conda内搜索软件:conda search 软件名

4. 下载软件:conda install 软件名(自动安装加 -y)

5. 卸载软件:conda remove 软件名(自动删除加 -y)

6. 创建conda环境:如conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y

创建失败,暂时不知道原因。
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