今天学习了Linux环境下软件的安装,先上思维导图:
Linux环境下软件安装-思维导图.png
在Windows系统中,软件安装是在其应用商店搜索软件,再下载安装。那么在Linux小企鹅中,conda就扮演Windows中应用商店这一角色,接下来总结一下linux中的软件下载安装:
1. miniconda3的下载安装和激活
下载:wget 下载链接
安装:bash 脚本名
激活:source ~/.bashrc
miniconda3 安装.png
2. 查看conda内的软件列表:conda list
conda list.png
3. conda内搜索软件:conda search 软件名
conda search fastqc.png
4. 下载软件:conda install 软件名(自动安装加 -y)
成功自动安装指定fastqc.jpg
5. 卸载软件:conda remove 软件名(自动删除加 -y)
自动删除 指定版fastqc.png
6. 创建conda环境:如conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
创建conda环境.png
创建失败,暂时不知道原因。
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