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学习小组Day4笔记--孔嘉豪

学习小组Day4笔记--孔嘉豪

作者: 孔嘉豪 | 来源:发表于2020-09-18 03:49 被阅读0次

Day1 高效学习平台和方法推荐
Day2-3 Linux基础
Day4-6 R语言基础
Day7 测序知识

w(゚Д゚)w 在开始今天R的学习前,先把昨天的conda分身完成了。(寻思着每次打开Xshell都要重新登录账号太麻烦,通过几次试错终于完成了设置,现在双击一下就能登陆了!!#撒花)
1. conda info --envs 查看分身环境
2. conda create -n (rna-seq) (python=3 fastqc trimmomatic) -y 新建环境\安装软件
3. conda activate 实现切换和更改默认缓解

今日待解决问题:

  1. 安装R(基础)和Rstudio(人性化一些的界面)
  2. 粗略了解R语言是什么,干什么的,认识Rstudio的工作界面
  3. 学会外观设置和基本操作
  4. 完成第一个R做的图

下载R和Rstudio,设置外观


    无需VPN的RRstudio下载链接,无脑安装。具体操作参考给自己一个全新的R语言环境

  • Rstudio安装遇到了些问题,单凭教程当Rstudio杠上中文用户名 设置后仍无法运行,将系统语言更换英语(美国)后,便能正常使用。

认识R和Rstudio


    R是一门编程语言,适用于统计分析、绘图的语言和操作环境。个人理解Rstudio用图形界面的方式展示R语言,实质是信息转化过程,方便非计算机专业的人使用,就如其名studio。 via 生信星球

作图


  • plot() 函数,即散点图
  • nrom(x,y,z)函数,为随机正态分布,x为产生符合正态分布值的数量,y为平均值,z为标准差。从下图可以看出rnorm(50)默认产生平均值为0,标准差为1;rnrm(50,4)任然默认标准差为1。


    plot(rnorm(50)) plot(rnorm(50,4)) plot(rnorm(50,4,1)) plot(rnorm(50,0,1))

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