UK Biobank 是指通过标准化流程,收集并长期储存人体生物样本(如血液和 DNA)及样本采集对象生理、病理、社会经济信息的资源库,本质上也是一种大样本的人群前瞻性队列研究。 英国生物银行(UK Biobank,简称UKB;官网:https://www.ukbiobank.ac.uk/)作为目前世界上最为知名和开放的生物银行,自2006年建立以来已收集了英国各地50万名参与者的血液、尿液和唾液样本,以及完善的人口学、社会经济、生活方式和健康信息。根据2022年6月22日召开的UKB年会上公布的最新信息,使用UKB数据的中国研究者数量已位居全球第三,仅次于英国和美国的研究人员数量。
UKB数据库样本量超大、变量丰富、数据质量高,有望成为遗传社会科学研究的一座待挖掘“宝藏“,本次推送将介绍UKB数据的申请流程。UKB数据的申请流程主要分为两大步骤:首先需申请研究人员账号,获批后再依托研究项目申请数据使用权限。UKB数据库所涵盖的具体变量介绍可以在https://biobank.ndph.ox.ac.uk/showcase/browse.cgi 网站查询。
第1步:UKB研究人员账号申请:
在UKB官网(https://www.ukbiobank.ac.uk/)点击上部的”Researcher login“,再点击链接中的”Sign up to access UK Biobank resources“,输入相关信息,完成后会收到账号激活的邮件。注意,收到激活邮件后仍需要进一步填写研究人员相关信息、所使用的大学或机构邮箱地址、论文发表记录等,完成或会进入”Under review“阶段,由UKB工作人员进行审核,时间大致在2周左右,请耐心等待。
注册信息
第2步:申请UKB项目及数据使用权限:
UKB数据的使用需要依托项目申请。这需要申请人事先准备好研究项目的Proposal。登陆AMS系统后,点击Applications --> Start New Application,根据要求填写Proposal。
申请如果对Proposal撰写不熟悉,强烈建议在UKB的Approved Research专栏寻找灵感(https://www.ukbiobank.ac.uk/enable-your-research/approved-research)。这里有所有已批准项目的Lay Summary介绍,非常值得在申请阶段参考。
获批项目介绍
申请提交后,UKB的工作人员会对Proposal进行审核,时间大约需要6-8周。
第3步:提交数据使用协议并支付数据使用费:
申请获批后,UKB的工作人员会以电子邮件通知。申请人需要根据要求填写数据使用协议并付费。目前UKB数据使用费用分为三档,分别是3000英镑/6000英镑/9000英镑。第一档只包含问卷数据和基本的健康数据;第二档包含初步的基因数据;第三档包含额外的WGS/WES/Imaging数据。但即使是第二档数据,也有近40万人样本的Imputation基因数据,质量上乘。
数据描述
以上步骤全部完成通常需要最少2-3个月,之后就可以开启项目研究阶段!
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