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GeneATLAS的数据全部来自 UK Biobank 的452,264个英国白人样本。
总共囊括的表型有778个，位点有三千万个。
优点
网站所有关联分析的summary数据都是可以下载的。
而且提供了所有表型的原始基因型数据的曼哈顿图、imputation的曼哈段图、Q-Q Plot
可以说是相当贴心了。
缺点
不能下载原始基因型数据。
样本是欧洲群体，可能某些结果在其他群体有差异。
这个网站可以下载什么
1. 下载表型数据
比如搜索肥胖表型，会出现如下界面：
Manhattan Plot (genotyped)：
M8xvuj.md.png
Manhattan Plot (imputed)：
M8zk2F.md.png
Q-Q Plot：
M8znV1.md.png
此外，还提供了计算这个表型所用的样本信息。
比如case有多少例，control多少例。
男性和女性是否都纳入分析。
2. 下载一个或多个variants数据
见 search 栏的 by variants
3. 下载一段区域或者基因数据
见 search 栏的 by Region or Gene
4. 下载一个SNP位点的Phewas数据
见 search 栏的 Phewas
这个Phewas的意思是通过输入一个SNP位点，网站会返回这个SNP位点的所有表型的关联分析数据。
5. 下载一段区域的Phewas数据
见 search 栏的 Region Phewas
意思同4，只不过这个选项是搜索一段区域。
6. 通过P值的阈值筛选，下载数据
见 search 栏的 By significance
好了，今天就讲到这里，赶快试一下吧，难道你不好奇你研究的遗传位点/基因对700多个表型有没有贡献吗，又或者你研究的表型的遗传位点是什么？
试试，又花不了多少时间。
GeneATLAS网站在这：
http://geneatlas.roslin.ed.ac.uk/
此篇文章感谢bio生物信息群成员王静小伙伴提供的信息。
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