conda是什么？
conda是一个包，依赖和环境管理工具，适用于多种语言，如: Python, R, Scala, Java, Javascript, C/ C++, FORTRAN
Conda
conda安装
conda默认随miniconda或anaconda发行，因此要安装conda，只需要安装miniconda或anconda即可。
如果通过anaconda安装, 国内直接从官网下载安装包会比较慢，可以通过清华大学的源下载。
另外在使用anaconda中附带的conda安装软件包时，为了加快速度，也可以为conda设置使用清华的源，具体使用可以参考
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/help/anaconda/
conda 环境
一个conda环境就是一个目录包含所有的安装包和依赖，不同环境之间独立且不相互影响。跟python的虚拟环境virtualenv一样
conda packages
使用conda安装包时，默认是从https://repo.continuum.io/pkgs/搜索并下载的。
目录结构
安装anacoda后，在用户HOME目录下，会有一个anaconda目录，目录结构如下
$ tree -L 1 anaconda
anaconda
├── Anaconda-Navigator.app
├── bin
├── conda-meta
├── doc
├── envs # conda管理的环境信息
├── etc
├── include
├── lib
├── libexec
├── mkspecs
├── phrasebooks
├── pkgs # 里面是解压的软件安装包
├── plugins
├── python.app
├── qml
├── resources
├── sbin
├── share
├── ssl
└── translations
20 directories, 0 files
bin, include, lib, share里面是conda默认环境的文件
常用配置
conda默认的配置文件为~/.condarc，通过修改配置文件: 我们可以配置如下内容：
- conda从哪里获取安装包
- conda是否使用代理服务器
- conda从哪里获取环境信息
- 是否更新bash提示当conda环境激活的时候
- 等其它配置信息
查看所有配置信息
$ conda config --show --json
配置使用清华的源
$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
$ conda config --set show_channel_urls yes
配置安装软件时不要提示输入yes
$ conda config --set always_yes true
更多配置可以参考
https://conda.io/docs/user-guide/configuration/index.html
开始使用
conda 管理
# 查看当前版本
$ conda --version
conda 4.3.27
# 更新conda
$ conda update conda
conda环境管理
# 创建一个名为snowflakes的环境，并安装biopython（默认使用下载anconda时选择的python版本)
$ conda create --name snowflakes biopython
# 激活环境
$ source activate snowflakes
# 退出环境
$ source deactivate
# 创建名为bunnies，使用python 3.5版本的环境，并安装astroid和babel
$ conda create --name bunnies python=3.5 astroid babel
# 查看所有的环境
$ conda info --envs
# 复制snowflakes环境到flowers
conda create --name flowers --clone snowflakes
# 删除环境
$ conda remove --name flowers --all
conda python版本管理
conda把python看作和其他包一样，可以在创建虚拟环境的时候指定
# 查看可用的python版本
$ conda search --full-name python
# 安装不同版本的python
$ conda create --name snakes python=3
conda packages管理
查看可以通过conda命令安装的包名，可以在网站查看http://docs.continuum.io/anaconda/pkg-docs.html
# 查看当前环境下的已经安装的包
$ conda list
# 查找包
$ conda search beautifulsoup4
# 安装包到环境bunnies，不加--name时，默认安装到当前环境
$ conda install --name bunnies beautifulsoup4
conda默认从https://repo.continuum.io/pkgs/下载安装包，当无法找到需要的安装包时，可以通过Anaconda.org安装包, 在http://anaconda.org可以搜索可用的包并在包详情页面获取下载命令,如:
# 安装包bottleneck
$ conda install -c conda-forge bottleneck
# 检查安装结果
$ conda list
使用pip命令安装包，当无法使用conda安装，也无法从Anaconda.org下载到需要的安装包时，可以通过pip命令安装
$ pip install see
# 查看包
$ conda list
删除指定环境里的包
$ conda remove --name bunnies iopro
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