昨天,偶然发现:
8月22号,让生信小伙伴日顾夜盼的bioconda中国镜像已经在清华tuna镜像源的一个服务器上建成了,感谢那个去呐喊的小伙伴@hyacz。
镜像地址:
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
一直一来,小伙伴们倍受bioconda服务器在国外,没有国内镜像,下载软件缓慢,不时报错的煎熬。这个镜像的到来将为我们解决这个问题。
下面介绍一下镜像的使用方法:
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
进行一下速度对比,公司百兆电信宽带条件下,以安装bwa软件为例:
conda2.png
不使用镜像,平均速度169.09KB/s,还是在网络较好的情况下,而且下载大软件容易中断。
使用镜像情况,平均速度已经是1.86MB/s,整整提高了十倍,虽然可能还没有进入官方源,有个警告,但是不影响使用。我们可以把更多的时间用在分析数据而不是折腾软件上。
怎么样,给力吧?快点上车吧!
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