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七夕刚过,bioconda中国镜像来临

七夕刚过,bioconda中国镜像来临

作者: zd200572 | 来源:发表于2017-08-29 12:00 被阅读0次

    昨天,偶然发现:
    8月22号,让生信小伙伴日顾夜盼的bioconda中国镜像已经在清华tuna镜像源的一个服务器上建成了,感谢那个去呐喊的小伙伴@hyacz。
    镜像地址:
    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
    一直一来,小伙伴们倍受bioconda服务器在国外,没有国内镜像,下载软件缓慢,不时报错的煎熬。这个镜像的到来将为我们解决这个问题。
    下面介绍一下镜像的使用方法:
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
    conda config --set show_channel_urls yes
    进行一下速度对比,公司百兆电信宽带条件下,以安装bwa软件为例:

    conda1.png
    conda2.png

    不使用镜像,平均速度169.09KB/s,还是在网络较好的情况下,而且下载大软件容易中断。

    使用镜像情况,平均速度已经是1.86MB/s,整整提高了十倍,虽然可能还没有进入官方源,有个警告,但是不影响使用。我们可以把更多的时间用在分析数据而不是折腾软件上。
    怎么样,给力吧?快点上车吧!

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