为了保证每个应用程序开发商合法ID，防止部分开放商可能通过使用相同的Package Name来混淆替换已经安装的程序，我们需要对我们发布的APK文件进行唯一签名，保证我们每次发布的版本的一致性(如自动更新不会因为版本不一致而无法安装)。
在这里介绍两种签名的方法如下：
1、在命令行对apk签名：
创建key，需要用到keytool.exe
(位于C:\Program
Files\Java\jdk1.6.0_10\bin目录下)，使用产生的key对apk签名用到的是jarsigner.exe
(位于C:\Program
Files\Java\jdk1.6.0_10\bin目录下)，把上两个软件所在的目录添加到环境变量path后，打开cmd输入
C:\Documents and Settings\mzba>keytool -genkey -alias demo.keystore -keyalg RSA -validity 40000 -keystore demo.keystore
相关说明：
-genkey 产生密钥
-alias demo.keystore 别名 demo.keystore
-keyalg RSA 使用RSA算法对签名加密
-validity 40000 有效期限4000天
-keystore demo.keystore
C:\Documents and Settings\mzba>jarsigner -verbose -keystore demo.keystore -signedjar demo_signed.apk demo.apk demo.keystore
相关说明：
-verbose 输出签名的详细信息
-keystore demo.keystore 密钥库位置
-signedjar demor_signed.apk demo.apk demo.keystore 正式签名，三个参数中依次为签名后产生的文件demo_signed，要签名的文件demo.apk和密钥库demo.keystore.
注意事项：android工程的bin目录下的demo.apk默认是已经使用debug用户签名的，所以不能使用上述步骤对此文件再次签名。正确步骤应该是:在工程点击右键->Anroid
Tools-Export Unsigned Application Package导出的apk采用上述步骤签名。
2、使用Eclipse导出带签名的apk
首先，选择Export.../Android/Export Android Application
创建密钥库keystore,输入密钥库导出位置和密码，记住密码，下次Use existing keystore会用到。
填写密钥库信息，填写一些apk文件的密码，使用期限和组织单位的信息。
生成带签名的apk文件，到此就结束了。
使用你自己的同一个签名证书，就没有人能够覆盖你的应用程序，即使包名相同，所以影响有：
1) App升级。 使用相同签名的升级软件可以正常覆盖老版本的软件，否则系统比较发现新版本的签名证书和老版本的签名证书不一致，不会允许新版本安装成功的。
2) App模块化。android系统允许具有相同的App运行在同一个进程中，如果运行在同一个进程中，则他们相当于同一个App，但是你可以单独对他们升级更新，这是一种App级别的模块化思路。
3) 允许代码和数据共享。android中提供了一个基于签名的Permission标签。通过允许的设置，我们可以实现对不同App之间的访问和共享，如下：
AndroidManifest.xml：
其中protectionLevel标签有4种值：normal(缺省值),dangerous,signature,signatureOrSystem。
简单来说，normal是低风险的，所有的App不能访问和共享此App。
dangerous是高风险的，所有的App都能访问和共享此App。
signature是指具有相同签名的App可以访问和共享此App。
signatureOrSystem是指系统image中App和具有相同签名的App可以访问和共享此App，谷歌建议不要使用这个选项，因为签名就足够了，一般这个许可会被用在在一个image中需要共享一些特定的功能的情况下。
2>优化:
方法1:
具体操作：
幸运的是，对应用程序中的资源作对齐操作很简单：
· 使用ADT：
如果你使用导出向导的话，Eclipse中的ADT插件（从Ver. 0.9.3开始）就能自动对齐Release程序包。使用向导，右击工程属性，选择“Android Tools”> “Export Signed Application Package…”。当然，你还可以通过AndroidManifest.xml编辑器的第一页做到。
方法2：
手动操作：
为了能够手动对齐程序包，Android 1.6及以后的SDK的tools/文件夹下都有zipalign工具。你可以使用它来对齐任何版本下的程序包。你必须在签名apk文件后进行，使用以下命令
在Andoroid sdk 目录里面的tools 目录CMD下面输入： zipalign -v 4YouApkFile.apk destinationApkFile.apk
· 验证APK程序是否对齐：
以下的命令用于检查程序包是否进行了对齐：
在Andoroid sdk 目录里面的tools 目录CMD下面输入：zipalign -c -v 4 YouApkFile.apk
From : http://blog.163.com/zqy216_2008/blog/static/41193718201352905243959/
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