步骤一:多序列比对
步骤二:Seqlogo展示
由于分析需求需要使用PhastCons分析DNA的保守序列,以及使用SIFT软件分析氨基酸变异的有害性,经过一段时...
seqlogo图常用于展示特定为区域的序列信息,就像这样: 之前很好奇这种图是怎么画出来的,后面知道了一个R包:...
序列比对的作用: 1、基于相似性的鉴定及功能预测(如果序列保守的话,那么功能也可能会相似) 2、可能在同源进化上有...
1、获取所需基因的全长序列 分析方法[http://www.bioon.com.cn/sub/showarticl...
需要解决的问题: 准确获取基因X的某个保守区域H的蛋白序列及核酸序列,查看该段序列蛋白层面及核酸层面的变化情况。 ...
基因组的保守性常常与功能有关,保守性强的序列可能在细胞的发育和调控等方面发挥着至关重要的作用。分享一下一般的分析保...
27. 序列logo图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用seqLogo包绘制序列logo图 使用ggs...
微生物多样性分析:OTU和OTU代表序列界定,包括OTU和代表序列的挑选,物种分类分配,进化树分析等; 数据深入及...
本节讲解如何进行 motif 预测,seqlogo 和motif位置展示。 motif预测 motif 预测使用 ...
在生物信息分析中,经常需要做序列标识图(sequence logo)。例如,突出序列比对中的保守位置,用于研究结构...
本文标题:序列保守性分析及Seqlogo展示
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