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20190407 关于利用aptamer在血清中检测特定物质的1

20190407 关于利用aptamer在血清中检测特定物质的1

作者: 罗昭锋 | 来源:发表于2019-04-07 22:50 被阅读0次

关于利用aptamer在血清中检测特定物质的10篇相关文献

罗昭锋 20190407

文末附十篇文献信息,前面是介绍我调研的过程。

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【题记】想了解一下适配体在血清中的应用。所以今天就做了一个调研,这算是今天的调研成果。如果不写下来,看完就忘了,所以写下顺便分享一下,也许能给需要的朋友省点时间。

我做文献调研大致的流程是:

关键词检索(WOS、pubmed、scopus三个网站)、全部导入endnote、采用二分法快速浏览文献。(广告:见视频 https://study.163.com/course/introduction/1208964816.htm )之前的简书文章也介绍过。二分法,第一遍只浏览标题,分两类,不要的文献,或不确定的;第一遍筛选完,文献减少了一大半;接着看摘要,还是二分法,又剔除掉一部分。两遍看完,剩下的应该都是有用的,可以利用endnote自动下全文进行阅读,来获取详细信息。如果阅读英文较慢,可以借助翻译,辅助阅读。我最近还使用了讯飞有声,来“听”文献。把走路的时间也利用了一部分来获取文献信息。后面会在课程中介绍。

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1 Alvarez-Martos, I., Moller, A. & Ferapontova, E. E. Dopamine Binding and Analysis in Undiluted Human Serum and Blood by the RNA-Aptamer Electrode. ACS Chem Neurosci 10, 1706-1715, doi:10.1021/acschemneuro.8b00616 (2019).

这篇文章表明,多巴胺RNA-aptamer在电极表面,进行流动分析并且在血清样品的注射之后在磷酸盐缓冲溶液(PBS)中进行洗涤步骤时,可以最小化血清蛋白(但不是血液成分)的非特异性吸附。因此,可以用于未稀释血清样品的分析。

2 Wu, Y. et al. Ultrasensitive and high specific detection of non-small-cell lung cancer cells in human serum and clinical pleural effusion by aptamer-based fluorescence spectroscopy. Talanta 179, 501-506, doi:10.1016/j.talanta.2017.11.029 (2018).

5倍稀释的血液中进行检测。

3 Su, Y. et al. Extraction and detection of bisphenol A in human serum and urine by aptamer-functionalized magnetic nanoparticles. Anal Bioanal Chem 410, 1885-1891, doi:10.1007/s00216-017-0801-0 (2018).

将aptamer偶联到磁珠上,用aptamer功能化的磁珠用于富集血清和尿样中的BPA。也是要稀释的,怎么稀释没找到。

4 Alsager, O. A., Alotaibi, K. M., Alswieleh, A. M. & Alyamani, B. J. Colorimetric Aptasensor of Vitamin D3: A Novel Approach to Eliminate Residual Adhesion between Aptamers and Gold Nanoparticles. Sci Rep 8, 12947, doi:10.1038/s41598-018-31221-y (2018).

最相关的文章。维生素D3的适配体检测,基于纳米金技术。主要创新是增加了一步离心操作。之前没有离心时,由于aptamer可能由于与纳米金的非特异结合导致不会产生聚集现象。降低了检测灵敏度。【不过增加一步离心操作,对于大规模检测不是好消息】

5 Lee, B. H., Nguyen, V. T. & Gu, M. B. Highly sensitive detection of 25-HydroxyvitaminD3 by using a target-induced displacement of aptamer. Biosens Bioelectron 88, 174-180, doi:10.1016/j.bios.2016.08.011 (2017).

筛选+检测应用的文章。文章中说是aptamer亲和力11nM,不过看ITC实验结果,感觉这个数据不大可信。提到血液中加标检测,检测到的浓度一直低于加标的浓度。

6 Yang, X. et al. Determination of free tryptophan in serum with aptamer--comparison of two aptasensors. Talanta 131, 672-677, doi:10.1016/j.talanta.2014.08.023 (2015).

检测L-色氨酸,在25%血清中具有10-500μM的良好线性关系和6.97μM的检测限。两种方法,一是基于石墨烯吸附aptamer产生淬灭荧光信号,加入靶分子,竞争下来产生荧光;二是利用分子信标的方法。

7 Shi, H. et al. Locked nucleic acid/DNA chimeric aptamer probe for tumor diagnosis with improved serum stability and extended imaging window in vivo. Anal Chim Acta 812, 138-144, doi:10.1016/j.aca.2013.12.023 (2014).

这篇文章主要介绍通过修饰来增加DNA aptamer在血清中的稳定性。半衰期由0.5小时延长到5小时。主要是LNA和3'-3'-胸苷(3'-3'-T)加帽。

8 Ge, J., Liu, Z. F. & Zhao, X. S. Cocaine Detection in Blood Serum Using Aptamer Biosensor on Gold Nanoparticles and Progressive Dilution. Chinese Journal of Chemistry 30, 2023-2028, doi:10.1002/cjoc.201200256 (2012).

在不预处理样品的情况下实现血清中可卡因的同时定性和定量分析。作者使用的是胎牛血清。下图为检测原理图。

9 Bruno, J. G., Carrillo, M. P., Phillips, T. & Edge, A. Serum inverts and improves the fluorescence response of an aptamer beacon to various vitamin D analytes. Luminescence 27, 51-58, doi:10.1002/bio.1324 (2012).

文章发现具有light up效应的aptamer,当用于血清中检测时,出现 light off效应。作者推测可能是肌酸酐和尿素的原因,但实验结果认为不是肌酸酐和尿素所致。说明血清中还有很多未知的干扰物存在。

10 Huang, P. J. & Liu, J. Flow cytometry-assisted detection of adenosine in serum with an immobilized aptamer sensor. Anal Chem 82, 4020-4026, doi:10.1021/ac9028505 (2010).

腺苷的检测限在缓冲液中为178μM,在30%血清中为167μM。最后,我们证明了检测可以在10微升90%的人血清中进行。【刘珏文的工作】左图为构建传感器,右图为流式检测的结果图。这个方案可以考虑,流式的通量比较高,可以自动化。

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