2020-06-25 线粒体基因组组装软件 MitoZ

作者: 热爱大自然的小和尚 | 来源:发表于2020-06-25 18:55 被阅读0次

线粒体组装软件MitoZ安装及运行
2020-06-25 线粒体基因组组装软件 MitoZ
线粒体组装软件(2) NOVOPlasty
线粒体组装软件（1）Mitofinder
生物信息软件收集
Bacteria genome denovo assembly
常用转录组组装软件集合
线粒体组装软件比较
线粒体|GetOrganelle组装软件
细胞器基因组的组装和注释（Getorganelle ）

这个软件在组装单个体基因组测序数据中的MG的时候很不错，基本上可以完成所以的分析流程
可以用于注释我们自己的MG，但是一定要注意fasta的sequence id不可以太长，会运行失败。失败的地方是这个

/app/anaconda/bin/python3 /app/release_MitoZ_v2.3/bin/common/genbank_gene_stat_v2.py

线粒体组装软件MitoZ安装及运行
线粒体组装软件MitoZ安装报错：sqlite3.IntegrityError: UNIQUE constrain...
2020-06-25 线粒体基因组组装软件 MitoZ
这个软件在组装单个体基因组测序数据中的MG的时候很不错，基本上可以完成所以的分析流程可以用于注释我们自己的MG，...
线粒体组装软件(2) NOVOPlasty
NOVOPlasty是一个小型环状基因组的软件，这意味着这个软件可以组装线粒体基因组和叶绿体基因组。这个软件是一个...
线粒体组装软件（1）Mitofinder
软件介绍听名字就可以猜出来Mitofinder是一个专门用于组装线粒体基因组的软件，该软件运行于liunx平台，...
生物信息软件收集
1 . 线粒体组装软件 1.1 ARC 1.2 MITObim
Bacteria genome denovo assembly
细菌基因组组装金标准：GAGE-B 组装软件的选择细菌基因组组装的目标不同于大型生物基因组的组装，大型基因组组装...
常用转录组组装软件集合
转录组组装软件基因组组装基因组组装（Genome assembly）是指使用测序方法将待测物种的基因组生成序列...
线粒体组装软件比较
一键线粒体组装软件大比拼 [toc] 1. mitobim 1.1 软件信息发表日期：2013年软件下载地址：...
线粒体|GetOrganelle组装软件
GetOrganelle https://github.com/Kinggerm/GetOrganelle[htt...
细胞器基因组的组装和注释（Getorganelle ）
之前有过用二代测序的数据组装植物叶绿体基因组昆虫线粒体的经历，用的是单位的超算（Linux系统）。用到的软件为G...