蛋白质基础分析

NCBI数据库常用四个子库: PubMed、BLAST、Nucleotide、Protein.

对于一个蛋白质的基础分析:

1. 获得蛋白质序列：NCBI

2. 预测信号肽: SignalP 4.1 Server

3.等电点和分子量：Compute PI/Mw(此PI值为根据一级序列得来的理论值，并非三级结构最终的确切值)

4. 预测跨膜区: TMHMM

5. 糖基化预测:

      N-糖基化预测: NetNGlyC 1.0 server

6. Protein结构解析出来没？

BLAST---Protein Blast 进行比对

根据PDB编号，在PDB数据库下载PDB格式文件，用Pymol软件看

7. 预测蛋白质结构的软件: SWISS-MODEL和Phyre2