数据库
1、PubMed数据库
检索技巧
- AU：作者
- TI：标题
- AB：摘要
- AD：地址
示例：dUTPase [TIAB] Beijing [AD]
2、GenBank核酸序列数据库
一级核酸数据库包括：GenBank(NCBI)、ENA（EMBL）、DDBJ（NIJ)
3、基因组数据库Ensemble
4、微生物宏基因组数据库JCVI
5、二级核酸数据库
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RefSeq数据库：非冗余数据库，有基因组序列，蛋白序列，和转录序列
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EST数据库：表达序列标签数据库
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Gene数据库
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ncRNA数据库
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microRNA数据库
6、一级蛋白质序列数据库（UniProt数据库）
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Swiss-Prot 人工注释
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TrEMBL 计算机翻译除去Swiss-Prot中的序列
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PIR 蛋白质信息资源数据库
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UniProt数据库有三层：UniParc（所有序列）、UniRef（去除重复序列）、UniProtKB（Swiss-Prot、TrEMBL）
7、一级蛋白质结构数据库
PDB数据库
8、二级蛋白质数据库
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Pfam：根据序列来推知未知功能的蛋白质上有哪些已知的结构域
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CATH：Class、Architecture、Topology、Homologous superfamily 以结构域分类，包括PDB的蛋白质和公共数据库的蛋白质序列做出的预测
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SCOP2 主要关注进化关系，依赖于人工验证
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