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通常自己的目标基因要在公共数据库看是否影响生存

通常自己的目标基因要在公共数据库看是否影响生存

作者: 因地制宜的生信达人 | 来源:发表于2018-12-25 18:47 被阅读34次

通常自己的目标基因要在公共数据库看是否影响生存

看到一篇文章提到了这个分析,其实这样的分析已经常规化了。

重点是作者对自己的生物学领域背景知识的把控能力,比如首先应该是知道哪些数据集是可以拿来使用的。

作者使用的是Tothill的2008文章的数据集,发现自己感兴趣的基因的两个探针都显著性的影响生存,文章是:Tothill, R. W. et al. Novel molecular subtypes of serous and endometrioid ovarian cancer linked to clinical outcome. Clin. Cancer Res. 14, 5198–5208 (2008).

常规化流程,不会代码的可以利用网页工具,会代码的当然是在R里面探索各式各样的数据集咯 。

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