大白鲨基因组揭示基因组稳定性以及伤口愈合在软骨鱼类中的适应性进化

大白鲨(Carcharodon carcharias)又称噬人鲨，身长可达6.5m，体重大约为3200kg，寿命超过73y，尾呈新月形，牙大且有锯齿缘，呈三角形，牙长10cm，大型进攻性鲨鱼。

摘要

大白鲨是公认的海洋动物之一。本研究对大白鲨进行了基因组测序，并且结合板鳃亚纲（鲸鲨、姥鲨）及其他脊椎动物的基因组进行了比较基因组学进化分析。大白鲨的基因组大小为4.93Gb，预测编码基因有24520个，并且存在58.5%的重复序列。研究提供了软骨鱼类关于基因组稳定性相关基因与功能类别的正选择以及基因富集的证据。作者推测鲸鲨与大白鲨在基因组稳定性方面发生适应性进化是对它们具有较大的基因组、高含量重复序列、大体型以及长寿命而受到综合选择压力的反映。伤口愈合的分子适应也是明显的，在伤口愈合通路中关键基因的正选择，以及伤口愈合通路的显著富集。鲨鱼，尤其是像大白鲨这样的顶级食肉动物，被认为具有敏锐的嗅觉。然而，我们发现鲨鱼的嗅觉受体基因很少，微量胺相关受体很少，而且G蛋白偶联受体的数量也极低。然而，我们确实在白鲨和鲸鲨中分别鉴定了13种V2R基因和10种V2R基因，再加上之前报道的姥鲨具有30多个V2R基因，表明这个基因家族可能是软骨鱼具有敏锐嗅觉的分子基础。

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